Tematy sonetów Szekspira badają idee miłości, starzenia się, piękna, czasu, pożądania, praktycznych obowiązków i poczucia niekompetencji. Tematy te wyłaniają się z szekspirowskich opisów relacji między jego bohaterami. Są one również widoczne w jego języku narracyjnym i wyjaśnianiu wewnętrznych uczuć mówiącego. Dodatkowe tematy sonetów szekspirowskich obejmują walkę między tym, co społeczeństwo zbiorowe jest gotowe zaakceptować, a indywidualnymi pragnieniami.
W poezji Szekspira kryje się idea, że piękno z czasem znika, czyniąc osobę mniej pożądaną i nieco przygnębioną własną egzystencją. Ideą jednego z najbardziej płodnych tematów sonetów szekspirowskich jest to, że dzieci powinny się rodzić, aby zachować piękno. Ponieważ zdolność do utrzymania idealnej sylwetki i atrakcyjnego wyglądu jest niemożliwa, jedyną nadzieją jest stworzenie następnego pokolenia, które odziedziczy te cechy. Czas jest postrzegany jako wróg witalności, wartości i fizycznej tożsamości.
Kolejny z tematów sonetu Szekspira skupia się na idei konfliktu między prawdziwą miłością a prostym pożądaniem seksualnym. W opinii poety często niejasne jest to, co jest czym. Pożądanie może przybrać postać miłości i łatwo ją z nią pomylić. Istnieje pokusa, by podążać za tym, co jest wizualnie kuszące, zamiast poświęcać czas na odkrycie prawdziwego uczucia.
Szekspir bada również ideę, że miłość lub uczucia miłosne mogą być szkodliwe. W języku swojej poezji autor opisuje emocjonalne i fizyczne skutki uwikłania w romantyczne związki. Choroba jest jedną z konsekwencji, oprócz negatywnego poczucia izolacji, które pojawia się po rozstaniu. Istnieje również ryzyko podatności na zranienie w związku z romantycznym związkiem, ponieważ życie, decyzje i poglądy na siebie stają się od siebie zależne.
W tematach sonetów Szekspira jest użycie symboli. Niektóre z nich to gwiazdy, drzewa, kwiaty i pogoda. Na przykład powtarzający się symbol pogody i pór roku służy do komunikowania burzliwej natury kryjącej się za ludzkimi uczuciami. Relacje często przechodzą przez ten sam rodzaj cykli, co modele pogodowe, co Szekspir wyraźnie ilustruje językiem niektórych swoich wersetów.
Symbol gwiazd jest używany przez autora do przekazywania idei przeznaczenia. Zamiast akceptować ideę, że przeznaczenie jest z góry określone, Szekspir bada ideę indywidualnej zdolności do kreowania własnego losu. Kwiaty i drzewa reprezentują delikatną naturę życia i piękna. W pewnym sensie posiadanie piękna zobowiązuje człowieka do posiadania dzieci i zapewnienia korzystniejszego zestawu okoliczności dla przyszłych pokoleń.