Un microarray ADNc este o metodă de a afla care gene dintr-o celulă sunt active la un moment dat. Acest lucru este util pentru a distinge genele care acționează diferit în diferite tipuri de celule și, de asemenea, care gene sunt active în anumite condiții, cum ar fi cancerul. Denumirea ADNc derivă din utilizarea secvențelor mici de acid dezoxiribonucleic (ADN) care se lipesc de secvențele de acid ribonucleic (ARN) pe care celulele le exprimă. Aceste secvențe mici de ADN sunt complementare (c) cu secvențele de ARN, de unde lipiciitatea, și sunt, de asemenea, marcate cu etichete fluorescente, astfel încât un experimentator poate vedea ce secvențe de ARN sunt exprimate și în ce măsură.
Celulele conțin ADN ca model pentru toate proteinele de care o celulă are nevoie. Secvența ADN-ului reprezintă aminoacizii de care organismul are nevoie pentru a-i colecta împreună și a le înșira pentru a face o proteină. Între ADN și fabricarea proteinelor este o etapă intermediară. Celula copiază secvența genei într-o altă formă numită ARN mesager (ARNm). Apoi, mașina celulei citește ARNm ca instrucțiuni pentru proteina dorită.
Deoarece ARNm pentru anumite gene nu sunt toate exprimate continuu, geneticienii pot analiza ceea ce este exprimat în anumite condiții. O abordare utilă este de a compara celulele tumorale cu celulele sănătoase și de a vedea care gene exprimă ARNm diferit în cele două situații. Aceste informații pot indica apoi oamenii de știință către ținte pentru tratamente. Diferite tipuri de celule produc, de asemenea, modele diferite de ARNm, deoarece fiecare tip de celulă are o activitate diferită.
Baza unui microarray ADNc este că testul identifică ARNm exprimat dintr-o probă la o sensibilitate care permite experimentatorului să descopere care gene exprimă mai mult decât altele și care nu se exprimă deloc. Deoarece o microarray de ADNc testează de obicei sute de mii de secvențe de ARNm, aceasta este de obicei realizată de mașină. Analistul nu folosește ARNm-ul pe care îl extrage direct dintr-o celulă, ci mai degrabă face o copie a acelui ARNm ca secvență de ADN.
Companiile comerciale produc plăci de microarray cADN pentru laboratoare. Ei fac secvențele de ADN care corespund sutelor sau miilor de gene pe care experimentatorul dorește să le testeze și să le plaseze pe fiecare individual pe o singură lamă microarray. Aceasta reprezintă toate genele care ar putea fi exprimate în acel grup.
Secvențele complementare la ARNm pe care cercetătorul le extrage din celulă sunt apoi realizate în laborator prin copierea ARN-ului în ADN. Aceste produse au o secvență care se lipește de ADN-ul de pe diapozitivul cu microarray care ar fi produs ARNm. Apoi, analistul atașează molecule fluorescente pe aceste secvențe de ADNc.
Acoperirea lamei microarray în cADN permite oricăror secvențe complementare să se lipească împreună. Lama este apoi spălată pentru a îndepărta ADNc nelegat. Un scanner măsoară apoi cantitatea de fluorescență, dacă există, pe fiecare punct individual de ADN. Genele care exprimă mai mult ARNm vor avea mai mult ADNc fluorescent legat de ele decât genele care exprimă mai puțin ARNm. În acest fel, analistul își poate da seama care gene sunt mai active decât altele și poate compara rezultatele cu un alt tip de celulă.