Diferitele zone ale creierului mediu uman sunt în general responsabile pentru reacțiile inconștiente la stimuli externi. Semnalele neuronale care provin din multe dintre simțurile umane, inclusiv vederea, auzul și atingerea, sunt procesate aici. Controlul motor – numeroșii mușchi necesari pentru a crea orice mișcare a corpului – este coordonat aici. Atleții de înaltă semi-conștienți pot experimenta, inclusiv o imediată intensitate a vigilenței și a răspunsului fizic precis, provine din multe părți ale creierului mijlociu care funcționează în sincronicitate eficientă.
Din punct de vedere anatomic și funcțional, creierul uman este împărțit într-un creier anterior, creier posterior și creier mediu. Această din urmă zonă este aproape de centrul creierului și în cea mai mare parte nu este vizibilă, cu excepția unei vederi inferioare. Din punct de vedere medical, se numește mezencefal. În mod obișnuit, este considerată o extindere și o extindere a trunchiului cerebral, care este responsabilă pentru funcții autonome de bază, cum ar fi bătăile inimii, respirația și creșterea. În urma deciziei de a dormi, reglează linia subțire dintre odihnă și excitare necesară supraviețuirii și creșterii.
Mezencefalul este zona cea mai avansată a creierului. În timp ce oamenii au creier anterior și posterior foarte mari, toate animalele vertebrate cu sistem nervos central au această structură de bază a creierului. Arhitectura sa generală, organizarea părților, este, de altfel, aceeași, chiar și la animalele paleontologice fosilizate.
Una dintre părțile cele mai proeminente ale acestei zone a creierului vertebratelor este tectum, sau corpora quadrigemina, numită după structura cadranului său. Fiecare dintre cei patru lobi se numește colicul. Principalele fascicule de nervi optici de la fiecare ochi se încrucișează către părțile opuse ale tectumului. S-a dovedit clinic că coliculii superiori sau superiori sunt responsabili pentru mișcările sacadice ale ochilor, vibrația rapidă și minusculă a mușchilor oculari care permite perceperea liniilor și formelor. Perechea inferioară sau inferioară de coliculi primește semnale neuronale declanșate de energia luminoasă, undele sonore și gravitația înregistrate de urechi și primite de nervii trohleari respectivi.
Pedunculii cerebrali, legături mari de nervi de fiecare parte a măduvei spinării, reprezintă o altă zonă semnificativă a creierului. Ei transportă nu numai nervi eferenți instructivi, cum ar fi neuronul oculomotor responsabil cu dilatarea și constrângerea pupilelor ochilor, ci și nervii aferenți din celelalte organe de simț ale corpului. Unul dintre cele mai importante semnale neuronale este senzația de căldură, înregistrată în mare parte de nervii sensibili la temperatură ai pielii. Mezencefalul este responsabil pentru procesarea acestor date critice de mediu și pentru emiterea de măsuri corective, cum ar fi tremurul muscular.
O mare parte din încercarea creierului de a corecta răspunsul organismului la stimuli externi este chimică, nu comutatorul de pornire sau oprire a semnalelor electrice. Hipotalamusul și alte glande ale creierului își secretă substanțele chimice catalitice în substanța neagră, un țesut înnegrit de la miezul pedunculilor cerebrali. Unul dintre acești hormoni este dopamina, cunoscută că influențează dependențele, precum și naturi umane la fel de elementare ale civilizației, cum ar fi automotivarea și obișnuința socială.