Οι διαφορετικές επιλογές για το χλώριο υδρομασάζ είναι διχλωριούχο νάτριο, τριχλωρικό νάτριο και υγρό χλώριο. Αυτά τα χημικά διαλύματα είναι διαθέσιμα σε κοκκώδη, δισκία και υγρή μορφή και θα πρέπει να προστίθενται τακτικά στο νερό του σπα για να αποτραπεί η ανάπτυξη βακτηρίων. Η χλωρίωση αλμυρού νερού είναι επίσης δυνατή για χρήση με ειδικά σχεδιασμένα υδρομασάζ με θαλασσινό νερό, τα οποία πρέπει να είναι εξοπλισμένα με γεννήτρια μετατροπής.
Το χλώριο είναι ένα χημικό απολυμαντικό που σκοτώνει τους τύπους βακτηρίων που τείνουν να αναπτύσσονται σε ζεστό νερό. Το βρώμιο και το διγουανίδιο είναι οι άλλες δύο πιο συχνά χρησιμοποιούμενες χημικές ουσίες στη θεραπεία ιαματικών λουτρών και υδρομασάζ. Το χλώριο μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί ως μια μορφή θεραπείας σοκ δύο φορές την εβδομάδα στο νερό, το οποίο δρα ως παράγοντας λιμοκτονίας για να εμποδίσει τα βακτήρια να τρέφονται με οργανική ύλη στη μπανιέρα. Οι θεραπείες σοκ με χλώριο δεν είναι συμβατές με όλους τους άλλους τύπους χημικών προϊόντων υδρομασάζ, επομένως οι καταναλωτές θα πρέπει να διαβάζουν προσεκτικά τις προειδοποιητικές ετικέτες σε τυχόν παράγοντες χλωρίου που αγοράζονται για χρήση στα συστήματα σπα τους για να διασφαλίσουν ότι όλα τα χρησιμοποιούμενα διαλύματα συνεργάζονται καλά.
Το χλώριο του υδρομασάζ μπορεί να προστεθεί σε κοκκώδη μορφή ως ένα ασφαλές και αποτελεσματικό μέσο καθαρισμού του νερού και διατήρησης της σωστής ισορροπίας του pH. Το νερό υδρομασάζ θα πρέπει συνήθως να παραμένει μεταξύ ενός pH 7.2 και 7.8. Χαμηλότερες ή υψηλότερες τιμές μπορεί να οδηγήσουν στην ανάπτυξη φολίδων κατά μήκος των επιφανειών του εξοπλισμού θέρμανσης και του εσωτερικού κελύφους ή μπορεί να φάνε στον ηλεκτρικό εξοπλισμό και να καταστρέψουν μόνιμα τη μπανιέρα. Το κοκκώδες χλώριο υδρομασάζ είναι διαθέσιμο ως διχλωριούχο νάτριο, το οποίο έχει ουδέτερο pH, ή τριχλωρό νάτριο, το οποίο έχει χαμηλό pH και μπορεί ενδεχομένως να βλάψει τη μπανιέρα. Η προσθήκη χλωρίου με αυτόν τον τρόπο πρέπει να γίνεται με μικρές κουταλιές κάθε φορά έως ότου μια δοκιμή λωρίδας χλωρίου τοποθετημένη στο νερό μετρήσει τα χημικά σε κατάλληλα επίπεδα για απολύμανση.
Οι ταμπλέτες και οι υγρές μορφές του χλωρίου του υδρομασάζ δεν είναι ουδέτερου pH και μπορούν να επηρεάσουν αρνητικά την περιεκτικότητα της μπανιέρας σε νερό. Τα δισκία χλωρίου αποτελούνται από τριχλωριούχο νάτριο και μπορούν, με την πάροδο του χρόνου, να μειώσουν σημαντικά το pH του νερού και να το κάνουν όξινο. Το υγρό χλώριο τείνει να έχει pH περίπου 13, αυξάνοντας σημαντικά το συνολικό pH της μπανιέρας. Όταν το νερό του σπα γίνεται αλκαλικό και έχει αυτά τα υψηλά επίπεδα pH, προκαλεί το σχηματισμό εναποθέσεων ασβεστίου και λεπιών μέσα στη μπανιέρα.
Η χλωρίωση αλατιού είναι ένας τύπος απολυμαντικού που μπορεί να χρησιμοποιηθεί με ιαματικά λουτρά με θαλασσινό νερό. Αυτός ο τύπος χλωρίου υδρομασάζ χρησιμοποιεί ένα ηλεκτρικό ρεύμα χαμηλής φόρτισης που αντλείται μέσω μιας γεννήτριας για να μετατρέψει τη βάση αλατιού στο νερό σε χλώριο. Αυτό μπορεί να μειώσει σημαντικά την ποσότητα καθαρισμού της μπανιέρας που απαιτείται με την πάροδο του χρόνου και συχνά μειώνει την ποσότητα των χημικών ουσιών που πρέπει να μπουν στο νερό.