Cauzele dislexiei nu sunt încă pe deplin înțelese, dar se crede că sunt în mare parte ereditare. Alte cauze ale dislexiei ar putea include deficiența de auz în copilăria timpurie, care ar putea determina copiii foarte mici să înțeleagă greșit sunetele adecvate ale cuvintelor și literelor. Unii experți cred că dislexia apare din cauza diferențelor în modul în care este structurat sau funcționează creierul. Creierul persoanelor cu dislexie poate încerca să proceseze limbajul vorbit și scris în partea dreaptă a creierului, în timp ce creierul persoanelor care nu suferă de dislexie încearcă să proceseze limbajul în partea stângă. Alții cred că dislexia apare atunci când creierul în ansamblu pur și simplu nu se formează corect sau că o combinație a tuturor acestor factori ar putea fi responsabilă pentru dislexie.
Unii experți cred că deficiența de auz la copiii foarte mici îi poate determina să sufere de dislexie. Argumentul pentru această teorie este că acești copii mici aud și interpretează greșit aceste sunete ale limbajului și pot avea probleme în a potrivi literele cu sunetele lor corecte.
Alții cred că problemele cu dezvoltarea sau funcționarea creierului se numără printre cauzele principale ale dislexiei. Unii cercetători cred că creierul persoanelor cu dislexie pur și simplu nu se formează corespunzător, astfel încât conexiunile neuronale necesare pentru înțelegerea normală a limbajului nu sunt formate. Alții cred că creierul persoanelor cu dislexie încearcă să interpreteze limbajul din partea dreaptă a creierului. Se crede că creierul oamenilor normali interpretează limbajul din partea stângă a creierului, astfel încât o persoană care își folosește creierul drept pentru a interpreta limbajul poate fi într-un dezavantaj semnificativ.
Se crede că ereditatea este una dintre cauzele principale ale dislexiei. Cercetătorii cred că o combinație de gene poate fi implicată în dezvoltarea acestei afecțiuni. În plus, s-a descoperit că gemenii identici ai persoanelor cu această afecțiune sunt de obicei foarte probabil să sufere de ea. Persoanele care au dislexie sunt de obicei foarte probabil să aibă un părinte, bunic, mătușă, unchi sau frate cu dizabilități. Mulți cercetători admit, totuși, că cauzele dislexiei rămân misterioase și că unii sau toți acești factori, precum și factorii neidentificați încă, pot fi responsabili pentru această afecțiune.