Controlul pronației se referă, în general, la suportul arcului sau la alte caracteristici ale pantofilor de alergare care împiedică piciorul alergătorului să se rostogolească sau să se îndepărteze prea mult. Deși o anumită pronație – rostogolirea spre interior când piciorul lovește solul – este normală și necesară pentru o absorbție adecvată a șocurilor, suprapronația sau subpronarea, uneori numită supinație, modifică pasul unei persoane și poate duce la răni. Tendința unui alergător spre suprapronație sau subpronație poate fi descoperită prin mai multe metode, inclusiv observarea unui specialist în pantofi de alergare, alergarea pe o bandă de alergare specializată sau măsurarea arcului piciorului în timp ce staționați. Pantofii cu control al pronației sunt proiectați pentru a compensa suprapronarea sau subpronația, dar studiile științifice despre necesitatea sau eficacitatea lor sunt neconcludente.
Controlul pronației pantofilor de alergare poate fi de obicei clasificat ca stabilitate maximă, control moderat al mișcării, control ușor al mișcării sau neutru, în funcție de cantitatea de susținere a arcului. Aceste variații sunt concepute pentru a corecta suprapronarea sau subpronația alergătorului. Ele permit, de asemenea, diferitelor părți ale pantofului să se uzeze aproximativ în același ritm, în funcție de modul în care pronația alergătorului provoacă stres asupra pantofului. Pantofii cu stabilitate maximă au suport suplimentar pentru arc și sunt proiectați pentru a împiedica prăbușirea arcului în timpul alergării și să conducă la suprapronație. Pantofii moderati sau ușori cu control al mișcării au o cantitate medie de susținere, în timp ce pantofii neutri nu au mai mult suport în arc decât în restul pantofului.
Din 2010, însă, mulți specialiști în alergare au început să pună la îndoială înțelepciunea convențională a pantofilor de control al pronației. Cel puțin un studiu a constatat că alocarea aleatorie a alergătorilor la pantofi cu diferite niveluri de control al pronației nu a dus la mai multe răni decât alocarea pantofilor pe baza nivelului de pronație. De fapt, unii oameni susțin că alergatul desculț sau în pantofi de alergat „minimaliști” este de fapt cel mai bun mod de a corecta suprapronarea sau subpronarea. Conform acestei teorii, pantofii specializați tind să compenseze în exces slăbiciunile alergătorilor în loc să permită întărirea naturală a mușchilor de la picioare prin alergare.