Korzystanie z wanny z hydromasażem jest świetnym sposobem na relaks i cieszenie się kojącym ciepłem, ale może być również szkodliwe dla zdrowia, jeśli woda nie jest odpowiednio utrzymywana. Środek dezynfekujący do wanny z hydromasażem powinien być często używany, aby woda była wolna od bakterii, które mogą powodować choroby lub dyskomfort. Dwa najpopularniejsze środki do dezynfekcji wanien z hydromasażem to chlor i brom, chociaż istnieją inne metody dezynfekcji. Wybierając środek dezynfekujący, należy wziąć pod uwagę kilka czynników, w tym zapach środka chemicznego, jego wpływ na skórę, wpływ na elementy wanny z hydromasażem, koszt i sposób podawania środka dezynfekującego.
Chlor od dawna jest środkiem do dezynfekcji wanien z hydromasażem wybieranym przez większość konsumentów, ponieważ jest bardzo skuteczny i dość łatwy w użyciu. Chlor ma jednak wyraźny zapach, który może być nieprzyjemny dla kąpiących się, a substancja ta ma tendencję do wysuszania skóry, prowadząc do swędzenia, a nawet wysypki. Chlor również musi być dość często dodawany do wody w wannie z hydromasażem, w zależności od tego, jak często wanna jest używana. Ten środek dezynfekujący do wanny z hydromasażem zwykle należy dodawać do wody około dwa razy w tygodniu w wannie, która jest często używana.
Brom stał się bardziej popularnym środkiem dezynfekującym do wanien z hydromasażem, ponieważ jego zapach nie jest tak przytłaczający jak chlor, a jego działanie na skórę jest znacznie mniej żrące. Jest również łatwy do podania, ponieważ brom zwykle znajduje się w małym bloku, który jest umieszczany w filtrze wanny. Chlor zwykle występuje w postaci granulek i należy go dodawać bezpośrednio do wody w wannie z hydromasażem. Granulki muszą zostać rozpuszczone, zanim kąpiący się będą mogli skorzystać z wanny z hydromasażem. W przeciwieństwie do chloru, brom zwykle wystarczy dodać do wanny raz na dwa tygodnie.
Możliwe jest również wybranie bardziej naturalnych środków odkażających. Mineralne środki dezynfekujące można stosować w połączeniu z chlorem lub bromem, ale zwykle nie niezależnie od tych chemikaliów. Użycie naturalnego mineralnego środka dezynfekującego drastycznie zmniejszy ilość niezbędnego chloru lub bromu, co oznacza, że woda w wannie będzie czysta bez przytłaczającego zapachu żrących chemikaliów; woda będzie również mniej podrażniać skórę. Srebro koloidalne jest również czasami używane do zabijania bakterii w wannie z hydromasażem, chociaż należy go używać ostrożnie. Niezależnie od rodzaju użytego środka dezynfekującego do wanny, konieczne będzie monitorowanie poziomu pH wody podczas użytkowania, aby upewnić się, że wyposażenie wanny nie zostanie uszkodzone w wyniku obecności środka dezynfekującego.