Η σιπροφλοξασίνη χορηγείται συχνά για την καταπολέμηση βακτηριακών λοιμώξεων, αλλά υπάρχουν ορισμένες παρενέργειες που μπορούν να αναμένονται με τη χρήση αυτού του φαρμάκου. Μερικές από τις πιο κοινές επιπτώσεις αφορούν την περιοχή του στομάχου, καθώς τείνουν να περιλαμβάνουν ναυτία, διάρροια, καούρα και έμετο. Πονοκέφαλοι, κολπικός κνησμός και υπερβολική ούρηση μπορεί επίσης να εμφανιστούν σε ορισμένους ασθενείς, αν και τέτοιες παρενέργειες της σιπροφλοξασίνης συνήθως δεν απαιτούν άμεση ιατρική φροντίδα. Από την άλλη πλευρά, ορισμένα αρνητικά σημάδια θα πρέπει να αναφέρονται σε έναν γιατρό το συντομότερο δυνατό, όπως εξάνθημα, πυρετός, κατάθλιψη ή συμπτώματα που μοιάζουν με γρίπη. Μερικοί ζητούν ακόμη και επείγουσα θεραπεία, καθώς μπορεί να είναι απειλητικές για τη ζωή, όπως σφίξιμο στο λαιμό, συριγμός και ακανόνιστος καρδιακός παλμός.
Πολλοί ασθενείς που λαμβάνουν αυτό το φάρμακο θα υποφέρουν από κάποιες παρενέργειες μέχρι να το συνηθίσει ο οργανισμός τους, οπότε τα συμπτώματα θα πρέπει να υποχωρήσουν. Τα στομαχικά προβλήματα είναι μερικές από τις πιο συχνές παρενέργειες της σιπροφλοξασίνης, όπως διάρροια, ναυτία και έμετος. Μπορεί επίσης να εμφανιστεί καούρα και πόνος στο στομάχι και μπορεί να συνοδεύονται από πονοκεφάλους και επείγουσα ούρηση. Τέλος, τα θηλυκά μπορεί να παρατηρήσουν κάποια κολπική έκκριση και φαγούρα. Αν και αυτές οι παρενέργειες της σιπροφλοξασίνης είναι συχνά ενοχλητικές, δεν θεωρούνται απειλητικές για τη ζωή, επομένως οι ασθενείς που τις παρατηρούν ενθαρρύνονται να συνεχίσουν να παίρνουν το φάρμακο μέχρι να αναφέρουν το ζήτημα στον γιατρό τους στο επόμενο ραντεβού τους.
Ορισμένες ανεπιθύμητες ενέργειες της σιπροφλοξασίνης δεν θεωρούνται φυσιολογικές και μπορεί να οδηγήσουν σε σοβαρά προβλήματα. Για παράδειγμα, μερικοί άνθρωποι παρατηρούν δυσμενή σωματικά συμπτώματα που μπορεί να περιλαμβάνουν δερματικό εξάνθημα, κνίδωση, ξαφνικούς μώλωπες και τρόμο. Άλλοι μπορεί να υποθέσουν ότι έχουν γρίπη, καθώς μπορεί να εμφανιστεί κόπωση, πυρετός και απώλεια όρεξης. Αυτό που μπορεί να μην περιμένουν αυτοί οι ασθενείς είναι μια αλλαγή στην ψυχική κατάσταση, καθώς αυτό το φάρμακο μπορεί να προκαλέσει κατάθλιψη, άγχος, σύγχυση και παράνοια. Αυτές οι παρενέργειες της σιπροφλοξασίνης μπορούν να θεωρηθούν επικίνδυνες καθώς μπορεί να οδηγήσουν σε αυτοκτονία ή αυτοκινητιστικά ατυχήματα, αν και η αϋπνία, οι εφιάλτες και οι παραισθήσεις είναι πιο κοινά αποτελέσματα.
Ενώ όλες οι ανεπιθύμητες ενέργειες της σιπροφλοξασίνης πρέπει να αναφέρονται σε γιατρό, ορισμένες απαιτούν επείγουσα θεραπεία. Για παράδειγμα, μπορεί να γίνει δύσκολη η αναπνοή όταν παίρνετε αυτό το φάρμακο, καθώς ο λαιμός μπορεί να διογκωθεί. Αυτό συχνά οδηγεί σε συριγμό, αίσθημα σφίξιμο στο λαιμό και δυσκολία στην κατάποση. Ο καρδιακός παλμός μπορεί επίσης να γίνει ακανόνιστος, να χτυπά πιο γρήγορα από το συνηθισμένο, εν μέρει λόγω του πανικού του σώματος που δεν μπορεί να αναπνεύσει εύκολα. Μπορεί επίσης να προκύψουν επιληπτικές κρίσεις και λιποθυμία, γεγονός που καθιστά σημαντικό να λάβετε ιατρική φροντίδα το συντομότερο δυνατό.