Lotniczy lekarz sądowy przeprowadza badania fizyczne na potencjalnych lub obecnych kontrolerach ruchu lotniczego i pilotach, aby pomóc w ustaleniu, czy są oni zdolni do wykonywania wymaganych od nich obowiązków. Fizyczne obejmuje zebranie szczegółowej historii medycznej i ustalenie, czy pacjent ma jakiekolwiek problemy zdrowotne, które mogą utrudniać jego lub jej wykonywanie pracy lub narażać innych na ryzyko. Lekarz medycyny lotniczej przekazuje następnie tę informację wraz z zaleceniem komisji ds. orzecznictwa lekarskiego. Osoba może wykonywać te obowiązki w ramach swojej regularnej praktyki lub pracować w liniach lotniczych, na lotnisku lub w programie szkolenia pilotów w połączeniu ze swoją regularną praktyką kliniczną.
Pierwszą częścią pracy lekarza sądowego jest uzyskanie pełnej historii medycznej pacjenta. Obejmuje to żądanie wywiadu od lekarza pierwszego kontaktu pacjenta i przesłuchanie pacjenta podczas badania. Niezbędne informacje zazwyczaj obejmują historię rodzinną dotyczącą genetycznych problemów zdrowotnych, problemów z sercem i innych problemów medycznych, które mogły zostać przekazane pacjentowi. Lekarz orzecznik medycyny lotniczej będzie również musiał uzyskać od pacjenta informacje na temat jego lub jej problemów zdrowotnych w przeszłości, jego aktualnego stanu zdrowia oraz informacje o aktualnie przyjmowanych lekach.
Fizyczne badanie pacjenta jest również częścią bycia lekarzem medycyny lotniczej. Podczas tej części pracy lekarz będzie badał zakres ruchu pacjenta, słuchał jego serca i sprawdzał odruchy. Wykonywane jest również szczegółowe badanie wzroku, które sprawdza wzrok pacjenta i widzenie peryferyjne.
Po zebraniu wszystkich niezbędnych informacji lekarz medycyny lotniczej organizuje informacje zgodnie z wytycznymi agencji wydającej i przekazuje je w imieniu pacjenta do agencji. W oparciu o przeszkolenie lekarza orzecznika medycyny lotniczej, lekarz zazwyczaj dołącza informację, czy pacjent spełnia wszystkie wymagania dla klasy orzeczenia lekarskiego, o które się ubiega. W wielu przypadkach egzaminator dostarczy również pacjentowi kopię swojego raportu.
W większości krajów lekarz medycyny sądowej jest zobowiązany do prowadzenia praktyki medycyny klinicznej podczas wykonywania badań dla pilotów i kontrolerów ruchu lotniczego. Większość lekarzy orzeczników medycyny lotniczej prowadzi stałą praktykę lub pracuje dla praktyki i świadczy usługi dla miejscowej ludności, która chce uzyskać zaświadczenie lekarskie. W niektórych przypadkach lekarz medycyny sądowej uzyska umowę z linią lotniczą lub szkołą szkolenia pilotów i zapewni badania lekarskie specjalnie dla osób pracujących dla linii lotniczej lub szkoły lub dla potencjalnych pilotów.