Bez względu na to, jak zostanie posadzona lub wyhodowana, bulwa begonii w pewnym momencie w ciągu roku przejdzie w stan uśpienia. Bulwy begonii można jednak przechowywać w miesiącach zimowych i przesadzać na wiosnę. Najważniejszym czynnikiem podczas przechowywania bulw begonii jest jej całkowite wysuszenie. Zwykle osiąga się to poprzez przechowywanie go w workach lub materiałach, które odprowadzają wilgoć z powierzchni bańki. Muszą być również przechowywane w chłodnym miejscu i muszą być regularnie sprawdzane, aby upewnić się, że nie zaczęły na nie wpływać żadne choroby, grzyby lub szkodniki.
Pierwszym etapem przechowywania bulw begonii jest proces suszenia. Po wyjęciu bulwy z ziemi należy pozwolić jej całkowicie wyschnąć, najlepiej do momentu, gdy łodygi rośliny łatwo oddzielą się od bulwy. Cebule w kształcie dysku należy czyścić z brudu, gruzu i wszelkich owadów, które mogą się na nich znajdować, ale raczej suchym ręcznikiem lub szczotką niż wodą. Po całkowitym wyschnięciu bulwę można pokryć specjalnym proszkiem siarki, który może zapobiec rozwojowi grzybów na powierzchni.
Suszona bulwa begonii musi być przechowywana w czymś, co ochroni ją przed warunkami środowiskowymi, takimi jak kurz, szkodniki i przeciągi. Jednocześnie powietrze musi mieć możliwość cyrkulacji wokół bulwy. Jednym z powszechnych sposobów przechowywania bulw begonii jest umieszczenie jej w luźno zamkniętej papierowej torbie. Inną opcją jest perforowana plastikowa torba, podobna do tych używanych przez hodowców komercyjnych, która jest wypełniona lekką substancją, taką jak wermikulit.
Czasami torba nie jest potrzebna. Skrzynka po mleku pełna rozdrobnionych gazet może służyć do przechowywania bulw begonii. Jeśli roślina jest uprawiana w pomieszczeniu, można ją pozostawić bezpośrednio w suchej glebie doniczki, o ile doniczka jest umieszczona w chłodnym miejscu. Nawet w regionach, w których ziemia może nigdy nie doznać silnego mrozu, bulwy powinny być nadal przechowywane w pomieszczeniach na zimę, ponieważ w przeciwnym razie mogą gnić w ziemi w wyniku deszczu.
Właściwa temperatura przechowywania bulw begonii wynosi od 40° Fahrenheita do 50° Fahrenheita (około 4° Celsjusza do 10° Celsjusza). Jeśli przechowywanych jest wiele bulw, należy je podzielić na różne worki lub umieścić w odpowiedniej odległości od siebie, aby mieć pewność, że gnicie lub grzyby nie rozprzestrzenią się szybko na całą partię. Bulwy należy regularnie sprawdzać, a złe lub wątpliwe usuwać lub przynajmniej odsuwać od reszty.