Chociaż właściwa struktura artykułu badawczego może różnić się w zależności od dyscypliny, generalnie składa się on z czterech głównych części: wstępu, treści, zakończenia i listy odniesień. Wiedza o tym, jak uporządkować części artykułu badawczego, może pomóc uprościć proces pisania. Wprowadzenie powinno przedstawiać główny argument lub tezę artykułu i powinno przechodzić od informacji ogólnych do bardziej szczegółowych. Treść powinna składać się z samodzielnych akapitów lub sekcji, z których każdy broni tezy w nowy sposób, a konkluzja powinna podsumować artykuł i, w niektórych przypadkach, sugerować, gdzie mogą być potrzebne dalsze badania. Wreszcie, literatura powinna być ogólnie uszeregowana w porządku alfabetycznym i powinna być sformatowana zgodnie z konwencją stylu użytego w pozostałej części artykułu.
Jedną z najważniejszych części pracy naukowej jest wstęp, który przygotowuje czytelnika do informacji, które po nim następują poprzez sformułowanie tezy pracy. W zależności od długości referatu i wymagań stawianych przez prowadzącego, wstęp może składać się z jednego akapitu lub z kilku akapitów. Aby stworzyć dobrze płynące wprowadzenie, przydatne może być przejście od ogólnego do szczegółowego. Na przykład studentka pisząca artykuł naukowy, w której argumentuje, że energia słoneczna jest najlepszą formą energii odnawialnej, może rozpocząć swoje wprowadzenie od kilku zdań, które zawierają ogólne informacje na temat energii odnawialnej, a następnie przejść do przedstawienia własnego argumentu.
Paragrafy ciała są częściami artykułu badawczego, które przedstawiają dowody potwierdzające tezę autora. Każdy akapit główny powinien być samodzielną jednostką, która odnosi się do oddzielnego elementu argumentacji artykułu. Na przykład artykuł opowiadający się za energią słoneczną może zawierać jeden akapit główny wyjaśniający, że słońce jest niezawodnym źródłem energii, taki, który stwierdza, że sprzęt do wykorzystania energii słonecznej może być stosunkowo niedrogi, oraz taki, który pokazuje, że energię słoneczną można łatwo zamienione na energię elektryczną w gospodarstwie domowym. Główną ideę każdego akapitu należy umieścić na początku tego akapitu. Po tym pomyśle powinno następnie nastąpić kilka zdań zawierających konkretne dowody, które pisarka zebrała podczas swojej fazy badawczej.
Wniosek wydaje się być jedną z najkrótszych części artykułu badawczego, zwykle wymagającą zaledwie kilku zdań. Zazwyczaj konkluzja powinna ponownie przedstawiać główny argument artykułu i streszczać jego treść w bardzo zwięzły sposób. W zależności od preferencji instruktora, może być konieczne zasugerowanie, w jaki sposób dalsze badania mogą zostać podjęte w miejscu, w którym kończy się artykuł.
Wreszcie, większość artykułów naukowych kończy się listą odniesień, które były cytowane w artykule lub konsultowane, gdy autorka badała swój temat. Ogólnie rzecz biorąc, lista ta musi być przedstawiona w porządku alfabetycznym, z każdym wpisem wyszczególniającym pełne informacje o publikacji dla użytego źródła. Ponieważ dokładne zasady formatowania list referencyjnych mogą się znacznie różnić w zależności od dyscypliny, ważne jest, aby skonsultować się z instruktorem, aby dowiedzieć się, jak powinien wyglądać każdy wpis.