Jeśli chodzi o prowadzenie sieci, administratorzy napotykają wiele problemów związanych z zarządzaniem siecią, co ułatwia stosowanie zasad i strategii sieciowych. Piractwo i hakowanie to typowe problemy związane z prowadzeniem sieci, a to może znacznie kosztować firmy, jeśli nie są one kontrolowane. Wiele sieci jest bezprzewodowych, więc jednym z typowych problemów z zarządzaniem siecią jest zapewnienie, że zakłócenia bezprzewodowe nie uniemożliwiają działania sieci. Wiele sieci z czasem się powiększa, więc skalowalność staje się problemem dla większości administratorów. Pracownicy często potrzebują programów, jeśli mają wykonywać swoją pracę, a instalowanie programów na każdym komputerze i aktualizowanie ich może być trudne.
Hakowanie i piractwo mogą dotknąć każdego użytkownika komputera, ale większość hakerów aktywnie szuka sieci biznesowych częściej niż zwykłych użytkowników. Dzieje się tak, ponieważ sieci mają zwykle cenne informacje, które można sprzedać innym osobom lub firmom. Oznacza to, że administratorzy muszą stale obserwować hakerów. Podczas gdy zapory ogniowe i oprogramowanie antywirusowe powstrzymują niektórych hakerów, administratorzy mogą być zmuszeni do wykonania bardziej zaawansowanych środków bezpieczeństwa podczas ataku, aby uniemożliwić hakerowi zbyt głębokie wniknięcie w system.
Chociaż sieci bezprzewodowe mają wiele zalet, są podatne na zakłócenia, co jest przyczyną jednego z typowych problemów z zarządzaniem siecią. Zakłócenia bezprzewodowe mogą pochodzić z wielu powodów, a administratorzy muszą dołożyć wszelkich starań, aby te zakłócenia nie powodowały masowych przestojów. Zakłóceń nie można w pełni kontrolować, ponieważ uniemożliwiają to czynniki naturalne, ale administratorzy mogą próbować konfigurować sieci, więc zakłócenia występują rzadko.
Przy coraz większej liczbie danych i pracowników potrzebnych do działania sieci skalowalność jest jednym z najczęstszych problemów związanych z zarządzaniem siecią. Skalowalność wiąże się z koniecznością rozwoju sieci, co zmusza administratorów do wykonywania wielu zadań. Mogą być potrzebne nowe serwery, które wymagają więcej miejsca do przechowywania serwerów; serwery mogą podnieść koszty operacyjne z powodu energii i ciepła; a ogromna ilość potrzebnej pamięci musi być odpowiednio utrzymywana. Zadaniem administratorów jest zarządzanie nowym rozmiarem sieci, a także skalowanie sieci w jak najmniej kosztowny sposób.
Instalowanie i zarządzanie oprogramowaniem na wszystkich komputerach w sieci to jeden z problemów związanych z zarządzaniem siecią, który może być bardzo żmudny. Administratorzy muszą przejść przez każdy komputer, aby upewnić się, że każdy ma odpowiednie oprogramowanie, a także muszą aktualizować oprogramowanie. Często istnieją programy, których administratorzy mogą używać, aby uprościć to zadanie, ale w niektórych przypadkach nadal może być potrzebna ręczna instalacja.