Niektóre z najczęstszych skutków ubocznych związanych z kanałem korzeniowym obejmują ból lub dyskomfort, zatrzymanie wzrostu zęba oraz ewentualne przebarwienie i osłabienie zęba. Chociaż niektóre z tych działań niepożądanych wymagają dodatkowej pracy dentystycznej, zazwyczaj są one nieszkodliwe i rzadko wskazują na problemy z kanałem korzeniowym. Jednak inne skutki uboczne mogą oznaczać komplikacje związane z kanałem korzeniowym. Te działania niepożądane obejmują silny ból, infekcję i pęknięty ząb. Dentysta może być w stanie odwrócić te komplikacje lub pacjent może potrzebować operacji, aby uratować ząb.
Prawdopodobnie najczęstszym działaniem niepożądanym związanym z kanałem korzeniowym jest łagodny do umiarkowanego dyskomfort lub ból, które pacjent może odczuwać zarówno w trakcie, jak i po zabiegu. Wielu pacjentów opisuje ból, którego doświadczają podczas leczenia kanałowego, jako podobny do bólu, który występuje przy regularnym wypełnieniu zęba. Ponieważ pacjenci mają tendencję do odczuwania pewnego stanu zapalnego tkanek po leczeniu kanałowym, wielu z nich będzie odczuwać ten ból przez kilka dni po leczeniu kanałowym. Jest to szczególnie ważne, jeśli przed zabiegiem mieli już ból lub infekcję. Dentyści zwykle zalecają radzenie sobie z bólem za pomocą dostępnych bez recepty leków przeciwbólowych, dopóki nie zniknie.
Dodatkowe częste i niegroźne skutki uboczne leczenia kanałowego mogą obejmować drętwienie jamy ustnej i twarzy lub uczucie mrowienia. Wynika to z zastosowanego środka znieczulającego, który zapobiega odczuwaniu przez pacjenta bólu w trakcie zabiegu, a po kilku godzinach od opuszczenia gabinetu dentystycznego mija. Jeśli pacjent jest dzieckiem, ale ząb jest ząbkiem stałym, ząb może na dobre przestać rosnąć. U niektórych pacjentów pojawiają się małe rany lub pęcherze na dziąsłach w pobliżu zęba z powodu bakterii, które były wcześniej w zakażonym zębie i miazdze, ale powinny one zniknąć po kilku dniach. Pacjenci mogą również spodziewać się pewnego poziomu przebarwień i osłabienia zębów, chociaż te działania niepożądane w obrębie kanału korzeniowego mogą nie objawiać się przez lata po zabiegu.
Istnieją poważniejsze skutki uboczne, które mogą wskazywać na powikłania kanałowe. Należą do nich silny ból, który nie reaguje na leki przeciwbólowe OTC lub ustępuje w ciągu kilku dni, pęknięcie zęba lub jakiekolwiek inne bolesne lub „niespokojne” uczucie, które pacjent mógł mieć w związku z zębem, który nie ustępuje z dala. Każdy pacjent, który doświadcza tego rodzaju skutków ubocznych, powinien jak najszybciej udać się do dentysty, ponieważ mogą to być objawy pewnych problemów z kanałem korzeniowym, takich jak infekcja kanału korzeniowego. Niektóre problemy z kanałem korzeniowym można naprawić, a ząb uratować przez drugi kanał korzeniowy lub operację endodontyczną. Jeśli problemy są wystarczająco poważne, dentysta może potrzebować usunięcia zęba.
Jeśli pacjent odpowiednio zadba o swój ząb, może on trwać do końca życia. Mimo to niektóre skutki uboczne związane z kanałem korzeniowym, takie jak osłabienie i przebarwienia zębów, wymagają od dentysty i pacjenta zastanowienia się nad przyszłą pracą dentystyczną. Na przykład nałożenie stałego wypełnienia na ząb może pomóc w utrzymaniu go w bezpiecznym miejscu przez długi czas. Założenie korony na ząb może sprawić, że ząb utrzyma się jeszcze dłużej, być może na zawsze, a także ukryje przebarwienia. W zależności od sytuacji są to kwestie, które pacjent i dentysta mogą natychmiast omówić lub zachować na później.