Aby zminimalizować ryzyko przeniesienia chorób, strzykawkę należy użyć tylko raz, a następnie wysterylizować przed ponownym użyciem, aby nie przenosić drobnoustrojów lub chorób między pacjentami. Strzykawkę należy zanurzyć tylko w jednej fiolce z lekiem, a następnie włożyć do jednej osoby lub zwierzęcia przed jej demontażem i sterylizacją. Najlepszym sposobem sterylizacji strzykawki jest wystawienie na działanie wysokiej temperatury, chociaż istnieje wiele chemikaliów, które można wykorzystać do sterylizacji strzykawek, gdy dostęp do odpowiedniego sprzętu nie jest możliwy.
Najlepszym sposobem na wykonanie sterylizacji strzykawek jest użycie maszyn zwanych autoklawami, które często znajdują się w szpitalach i laboratoriach, gdzie służą do sterylizacji wielu różnych rodzajów sprzętu. Szklane strzykawki, które są już rzadko używane, można umieścić w tych maszynach i podgrzewać do temperatury 248 stopni Fahrenheita (120 stopni Celsjusza) przez 15 do 20 minut. Plastikowe strzykawki mogą ulec uszkodzeniu w tym upale i zwykle są przeznaczone do wyrzucenia po jednym użyciu. Igły używane do wykonywania zastrzyków można umieszczać w tych maszynach w celu sterylizacji i ponownie wykorzystywać. Małe gabinety lekarskie lub kliniki, które nie mają własnego autoklawu, często wysyłają skażone strzykawki do odpowiedniej sterylizacji i utylizacji.
Temperatura w autoklawie jest znacznie wyższa niż w przypadku wrzącej wody. Mimo to gotowanie szklanych strzykawek jest jednym ze sposobów sterylizacji strzykawek. Ta metoda nie jest tak skuteczna jak użycie autoklawu i może rozprzestrzeniać chorobę, ponieważ niekoniecznie zabija wszystkie zarodniki. Ta metoda powinna być używana tylko w nagłych wypadkach. Do wody należy dodać niewielką ilość alkoholu fenolowego, aby usprawnić sterylizację. Gdy woda się zagotuje, szklaną strzykawkę należy pozostawić na 15 do 20 minut.
Plastikowe strzykawki są zwykle przeznaczone do wyrzucenia po jednym użyciu. Mimo to mogą pojawić się sytuacje, w których dana osoba będzie musiała ponownie użyć strzykawki. W takim przypadku najlepsze wskazówki dotyczące sterylizacji strzykawek obejmują przepłukanie strzykawki wodą i wybielaczem.
W celu przeprowadzenia sterylizacji strzykawek wodą i wybielaczem, strzykawkę należy napełnić do połowy mieszanką i energicznie wstrząsnąć przed wypchnięciem płynu. Czynność tę należy powtarzać do momentu, gdy w strzykawce nie będzie śladu krwi ani lekarstw, zanim zostanie kilkakrotnie wypłukana czystą wodą. Nie wyeliminuje to wszystkich wirusów, bakterii ani innych zanieczyszczeń i powinno być wykonywane tylko w nagłych wypadkach, gdy sterylna strzykawka jest niedostępna.