Η πιο σπάνια ουσία είναι ότι το σύμπαν είναι πιθανώς το πλάσμα κουάρκ-γλουονίου ή κάτι παρόμοιο. Αυτή είναι μια φάση ύλης που δημιουργείται μόνο κάτω από τις πιο έντονες θερμοκρασίες και πιέσεις. Για το μεγαλύτερο μέρος του πρώτου εκατομμυριοστού του δευτερολέπτου μετά τη Μεγάλη Έκρηξη, το εκρηκτικό γεγονός που δημιούργησε το σύμπαν μας, όλη η ύλη είχε τη μορφή πλάσματος κουάρκ-γκλουονίων. Τα κουάρκ και τα γκλουόνια είναι σωματίδια που συνθέτουν νουκλεόνια όπως τα νετρόνια και τα πρωτόνια, τα οποία με τη σειρά τους αποτελούν τα άτομα που αποτελούν όλη την ύλη. Τα κουάρκ είναι τα σωματίδια με μάζα, ενώ τα γκλουόνια είναι τα σωματίδια που διαμεσολαβούν τη δύναμη που «κολλούν» τα κουάρκ μεταξύ τους.
Αν και το πλάσμα κουάρκ-γλουονίων είναι επί του παρόντος υποψήφιος για την πιο σπάνια ουσία στο σύμπαν, στην αρχή του, ήταν η κανονική κατάσταση της ύλης. Ένα πλάσμα κουάρκ-γλουονίων είναι ένα λουτρό από σχεδόν ελεύθερα κουάρκ και γκλουόνια, τα οποία τυπικά είναι σφιχτά κλειδωμένα σε νουκλεόνια. Τα συμβατικά νουκλεόνια συγκρατούνται τόσο σφιχτά μεταξύ τους που ακόμη και μια πυρηνική έκρηξη ή η θερμοκρασία και η πίεση στον πυρήνα του Ήλιου δεν αρκούν για να τα διαχωρίσουν. Τα ελεύθερα κουάρκ δεν έχουν παρατηρηθεί ποτέ και ορισμένοι φυσικοί πιστεύουν ότι το ίδιο το φαινόμενο των ελεύθερων κουάρκ είναι φυσικά αδύνατο.
Το πλάσμα κουάρκ-γκλουονίων δημιουργείται σε ορισμένες ασυνήθιστες συνθήκες έξω από τη Μεγάλη Έκρηξη. Ήμασταν σε θέση να το παράγουμε κατά βούληση σε επιταχυντές σωματιδίων, χρησιμοποιώντας τεράστιες ποσότητες ενέργειας εστιασμένες σε βαρέα ιόντα, από το έτος 2000. Χρειάστηκαν περίπου δύο δεκαετίες προσπάθειας για να το δημιουργήσουμε, την πιο σπάνια ουσία που γνωρίζουμε. Το κατόρθωμα επιτεύχθηκε στον επιταχυντή σωματιδίων CERN στην Ελβετία. Πιο πρόσφατα, ο Μεγάλος Επιταχυντής Αδρονίων του CERN διεξάγει πειράματα στο πλάσμα κουάρκ-γλουονίων.
Το πλάσμα κουάρκ-γλουονίου μπορεί στην πραγματικότητα να μην είναι η πιο σπάνια ουσία αν αποδειχθεί ότι υπάρχει στα κέντρα αστεριών εξαιρετικά μεγάλης μάζας. Μερικά αστέρια νετρονίων (το απομεινάρι που άφησαν μερικά από τα μεγαλύτερα σουπερνόβα) είναι πιο πυκνά από ό,τι θα προβλεπόταν από τη θεωρία, με αποτέλεσμα ορισμένοι επιστήμονες να υποψιαστούν ότι στην πραγματικότητα δεν πρόκειται για αστέρια νετρονίων, αλλά για αστέρια κουάρκ. Τα αστέρια νετρονίων έχουν ακτίνα μεταξύ 10 και 20 km (6 – 12 mi), αλλά μια μάζα ελαφρώς μεγαλύτερη από αυτή του Ήλιου. Αντίθετα, τα αστέρια κουάρκ, αν υπάρχουν, θα έχουν ακτίνα μεταξύ 3 και 9 km (2-6 mi) και μάζα συγκρίσιμη με τα αστέρια νετρονίων, καθιστώντας τα τα πιο πυκνά αντικείμενα στο σύμπαν. Το απομεινάρι σουπερνόβα RX J1856.5-3754, το άστρο νετρονίων που βρίσκεται πιο κοντά στη Γη, είναι ένας πιθανός υποψήφιος για να είναι αστέρι κουάρκ.
Υπάρχουν και άλλες ουσίες που διεκδικούν τον τίτλο της πιο σπάνιας ουσίας στο σύμπαν. Αυτά περιλαμβάνουν τα εξωτικά σωματίδια που δημιουργούνται κάτω από συγκρούσεις κοσμικών ακτίνων πολύ υψηλής ενέργειας και άλλα εξωτικά σωματίδια που υπήρχαν στην αυγή του σύμπαντος αλλά δεν έχουν ξαναφανεί έκτοτε. Η αντιύλη δεν πληροί τις προϋποθέσεις ως η πιο σπάνια ουσία στο σύμπαν, επειδή μπορεί ακόμα να βρεθεί να επιπλέει στο διάστημα σχεδόν παντού, αν και σε πολύ χαμηλές αναλογίες.