Η επιλογή των καλύτερων αντιβιοτικών για τη γονόρροια μπορεί να εξαρτάται από διάφορους παράγοντες. Αυτά περιλαμβάνουν την προηγούμενη ανταπόκριση ενός ατόμου σε φάρμακα πρώτης γραμμής και τον τύπο της γονόρροιας που υπάρχει. Έχει επίσης σημασία εάν τα άτομα μολύνονται ταυτόχρονα με χλαμύδια, κάτι που δεν είναι ιδιαίτερα σπάνιο. Σε αυτές τις περιπτώσεις, μπορεί να χρειαστεί να δοκιμαστούν περισσότερα από ένα αντιβιοτικά.
Από το 2007, τα Κέντρα Ελέγχου Νοσημάτων των ΗΠΑ (CDC) δημοσίευσαν σαφείς οδηγούς σχετικά με τον τρόπο επιλογής των καλύτερων αντιβιοτικών για τη γονόρροια. Λίγο πριν από αυτή τη δημοσίευση, μελέτες έδειξαν ότι μια κοινή ομάδα αντιβακτηριακών φαρμάκων, που ονομάζονται floroquinolones, είχε αρχίσει να είναι αναποτελεσματική και στελέχη της σεξουαλικά μεταδιδόμενης νόσου έδειχναν ανθεκτικότητα σε αυτήν. Όπως αποδεικνύεται, η γονόρροια συμπεριφέρθηκε με αυτόν τον τρόπο στο παρελθόν με άλλα αντιβιοτικά. Κανονικά δεν ανταποκρίνεται ούτε στη θεραπεία με φάρμακα όπως η πενικιλίνη ή η τετρακυκλίνη.
Το CDC εξέδωσε συστάσεις για τα καλύτερα φάρμακα για τη γονόρροια με βάση αυτή την αντίσταση που ανακαλύφθηκε πρόσφατα στις φθοριοκινολόνες, υποδεικνύοντας ότι τα άτομα με απλές περιπτώσεις γονόρροιας λοίμωξης των γεννητικών οργάνων λαμβάνουν μία μόνο ενδομυϊκή ένεση κεφτριαξόνης. Αυτό είναι ένα φάρμακο κεφαλοσπορίνης. Η κεφτριαξόνη ενδείκνυται επίσης για τη θεραπεία της γονόρροιας που εμφανίζεται στο λαιμό, που ονομάζεται φαρυγγική γονόρροια.
Εάν η ασθένεια επιπλέκεται από μόλυνση με χλαμύδια, συνήθως προστίθεται ένα δεύτερο από του στόματος αντιβιοτικό και αυτό μπορεί να είναι ένας από διάφορους τύπους και μπορεί να περιλαμβάνει κοινά φάρμακα όπως το Zithromax®. Υπάρχουν επίσης μερικά φάρμακα πολύ παρόμοια με την κεφτριαξόνη που δεν είναι διαθέσιμα στις ΗΠΑ και αυτά θα μπορούσαν να αποτελέσουν ιδανικά υποκατάστατα. Επιπλέον, εάν η γονόρροια είναι μια περίπλοκη λοίμωξη, η αρχική ένεση θα μπορούσε να ακολουθηθεί με από του στόματος δόσεις αντιβιοτικών.
Σε ορισμένες περιπτώσεις, η κεφτριαξόνη δημιουργεί προβλήματα. Δεδομένου ότι πρόκειται για κεφαλοσπορίνη, μερικοί άνθρωποι είναι αλλεργικοί σε αυτήν εάν είναι αλλεργικοί στην πενικιλίνη. Μια επιλογή είναι να αναζητήσετε τα επόμενα καλύτερα αντιβιοτικά για τη γονόρροια. Θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν φάρμακα όπως η δοξυκυκλίνη ή η κλαριθρομυκίνη. Μια άλλη προσέγγιση είναι η χρήση απευαισθητοποίησης στο φάρμακο πριν από τη χορήγηση του. Τις περισσότερες φορές δεν είναι απαραίτητο να το κάνετε αυτό και άλλα φάρμακα θα το υποκαταστήσουν επαρκώς. Είναι γνωστό ότι φάρμακα όπως το Zithromax® θα θεραπεύσουν τη μη επιπλεγμένη γονόρροια, αλλά υπάρχει ανησυχία ότι τα στελέχη της γονόρροιας θα αντισταθούν τελικά και στην αζιθρομυκίνη.
Η πλήρης εξέταση και το ιστορικό των φαρμακευτικών αλλεργιών ενός ασθενούς είναι σημαντική προκειμένου να επιλεγούν τα καλύτερα αντιβιοτικά για τη γονόρροια. Οι γιατροί χρησιμοποιούν κατευθυντήριες γραμμές αλλά λαμβάνουν αποφάσεις κατά περίπτωση. Αυτές οι αποφάσεις μπορεί να μην είναι πάντα ταυτόσημες με τις κατευθυντήριες γραμμές. Επιπλέον, οι γιατροί πρέπει να συνεχίσουν να αξιολογούν την ανάρρωση ενός ασθενούς. Μερικές φορές απαιτείται πρόσθετη θεραπεία ακόμη και αν έχει χρησιμοποιηθεί η καλύτερη και πιο συνιστώμενη θεραπεία.