Υπάρχουν πολλά είδη εσωτερικών παρασίτων, τα οποία βασικά χωρίζονται σε δύο ομάδες: τα μακροπαράσιτα και τα μικροπαράσιτα. Τα μακροπαράσιτα, όπως οι ταινίες, οι στρογγυλοί σκώληκες και οι φλύκταινες, είναι ορατά, αλλά τα μικροπαράσιτα, όπως οι ιοί, τα βακτήρια και οι μύκητες, μπορούν να φανούν μόνο με μικροσκόπιο. Και τα δύο μπορούν να ταξιδέψουν σε διαφορετικές περιοχές ή μπορούν να παραμείνουν σε μια συγκεκριμένη περιοχή του σώματος. Τα παράσιτα μπορούν να επηρεάσουν τα σωματικά όργανα, το μυελό των οστών και άλλες περιοχές του σώματος όπου αντλούν θρεπτικά συστατικά από τον ξενιστή, προκαλώντας ασθένεια, ακόμη και θάνατο, εάν δεν αντιμετωπιστούν έγκαιρα.
Ένα παράσιτο του παχέος εντέρου όπως το Dientamoeba fragilis κάνει το σπίτι του στο παχύ έντερο και αντλεί τα θρεπτικά συστατικά του από εκεί. Άλλα εσωτερικά παράσιτα που επηρεάζουν το παχύ έντερο και την πεπτική οδό είναι οι στρογγυλοί σκώληκες, όπως οι σκώληκες, οι αγκυλόστομες και οι μαστιγοί. Τα αυγά αυτών των παρασίτων καταπίνονται και μόλις εκκολαφθούν, μπορούν να συμβάλουν στην απώλεια βάρους, στη διάρροια, στα αιματηρά κόπρανα, στον κοιλιακό πόνο και στην αδυναμία. Ένα κοινό παράσιτο του στομάχου είναι το Giardia lamblia, το οποίο προσβάλλεται από μολυσμένα τρόφιμα ή νερό και μπορεί να προκαλέσει παρόμοια συμπτώματα όπως η γρίπη του στομάχου, όπως διάρροια, ναυτία και κοιλιακό άλγος. Άλλα εντερικά παράσιτα περιλαμβάνουν το Entamoeba histolytica, το blastocystis, το cryptosporidium και το Isospora belli.
Το Toxoplasma gondii είναι ένα παράσιτο του εγκεφάλου που επηρεάζει συνήθως τον εγκέφαλο καθώς και τους μύες, την καρδιά, το συκώτι και τα μάτια. Το παράσιτο καταπίνεται και κυκλοφορεί στο σώμα μέσω της κυκλοφορίας του αίματος. Άλλα εσωτερικά παράσιτα που επηρεάζουν τον εγκέφαλο περιλαμβάνουν τα Taenia solium, naegleria, acanthamoeba και schistosoma και άλλα αιμοσφαίρια. Τα εγκεφαλικά παράσιτα μπορεί να προκαλέσουν συμπτώματα που μοιάζουν με γρίπη, φλεγμονή στον εγκέφαλο, πυρετό, πονοκέφαλο, ψυχική σύγχυση, επιληπτικές κρίσεις και παραισθήσεις.
Τα ηπατικά παράσιτα, γνωστά και ως ηπατικά φλύκταινα, συνήθως βρίσκονται στο ήπαρ, αλλά μπορούν να μολύνουν και άλλες περιοχές. Λαμβάνονται από μολυσμένα τρόφιμα όπως τα ψάρια και όλα τα άλλα είδη κρέατος καθώς και από τα φυτά και τα λαχανικά του νερού. Τα συμπτώματα που προκύπτουν από παράσιτα του ήπατος περιλαμβάνουν μεγέθυνση σπλήνας και συκωτιού, απώλεια βάρους, πυρετό και πρησμένους αδένες.
Υπάρχουν διάφορες προσεγγίσεις για τη θεραπεία των εσωτερικών παρασίτων, όπως ο καθαρισμός των παρασίτων ή η χρήση αντιπαρασιτικών φαρμάκων. Τα κιτ καθαρισμού παρασίτων γενικά έχουν σχεδιαστεί για να στοχεύουν συγκεκριμένες περιοχές, όπως το κόλον, το συκώτι και το αίμα, καθώς και άλλες περιοχές όπου βρίσκονται τα παράσιτα. Μια υγιεινή διατροφή που αποτελείται από φρούτα και λαχανικά πλούσια σε φυτικές ίνες, σκόρδο και άλλα βότανα είναι επίσης ευεργετική για την απαλλαγή από εσωτερικά παράσιτα.