Η φαρμακευτική αγωγή ψύλλων για σκύλους διατίθεται σε διάφορες μορφές: σκόνες, σπρέι, λοσιόν και περιλαίμια, καθώς και σαμπουάν, σταγόνες και στοματικά φάρμακα. Κάθε μία από αυτές τις μορφές φαρμάκων ψύλλων για σκύλους παρέχει είτε θεραπεία για προσβολή, πρόληψη ή και τα δύο. Φάρμακα όπως πυρεθίνες και πυρεθροειδή, ιμιδακλοπρίδη, αρυλοτερόκυκλοι, μεταφλουμιζόνη και ρυθμιστές ανάπτυξης εντόμων διατίθενται σε διάφορες μορφές. Άλλα φάρμακα ψύλλων για σκύλους που είναι διαθέσιμα σε διάφορες μορφές περιλαμβάνουν σελαμεκτίνη, νιτενπυράμη, σπινοσάδη και πιο φυσικές θεραπείες ψύλλων όπως εκχυλίσματα εσπεριδοειδών και βορικό άλας.
Οι πυρεθίνες είναι ένα από τα πιο συχνά χρησιμοποιούμενα συστατικά στο φάρμακο ψύλλων για σκύλους. Εξάγονται από τα άνθη των φυτών χρυσάνθεμου και χρησιμοποιούνται ως αποτελεσματική θεραπεία ψύλλων για περισσότερο από έναν αιώνα. Αυτό το εκχύλισμα αλλάζει χημικά τα κύτταρα του νευρικού συστήματος των εντόμων, συμπεριλαμβανομένων των ψύλλων, των τσιμπουριών, των ψειρών και των κουνουπιών. Τα περισσότερα φάρμακα θεραπείας ψύλλων και κροτώνων που περιέχουν πυρεθίνες εφαρμόζονται απευθείας στο κατοικίδιο ζώο, όπως σκόνη ή σπρέι.
Τα πυρεθροειδή είναι συνθετικές πυρεθρίνες που έχουν συνταχθεί σε εργαστήριο. Όπως και με τις πυρεθρίνες, τα πυρεθροειδή ερεθίζουν και μεταβάλλουν μοιραία το νευρικό σύστημα των ψύλλων και των κροτώνων. Τα πυρεθροειδή λειτουργούν πιο αργά από τις πυρεθρίνες, αλλά παρέχουν πιο διαρκή αποτελέσματα, οπότε τα πυρεθροειδή χρησιμοποιούνται σε σπρέι και φάρμακα ψύλλων με βάση το λάδι για σκύλους. Αυτά τα φάρμακα είναι επιβλαβή για τις γάτες και μπορεί να προκαλέσουν προσωρινή τοξικότητα σε ευαίσθητα σκυλιά.
Τα περισσότερα φάρμακα ψύλλων για σκύλους λειτουργούν για να αλλάξουν το νευρικό σύστημα των εντόμων. Το Imidacloprid, ένα τοπικό εντομοκτόνο έλαιο που εφαρμόζεται κάθε μήνα, μπλοκάρει τους νευρικούς υποδοχείς. Οι αρυλοκυτταρικοί κύκλοι και τα φάρμακα μεταφλουμιζόνης προκαλούν παράλυση στους ψύλλους. Το Nitenpyram είναι ένα ασφαλές από του στόματος προϊόν, αλλά η αποτελεσματικότητά του είναι πολύ βραχύβια επειδή το φάρμακο συνήθως ξεπλένεται από το σύστημα του κατοικίδιου ζώου σε περίπου 24 ώρες. Το Spinosad, ένα άλλο από του στόματος προϊόν, τυπικά είναι αποτελεσματικό μόνο κατά των ενήλικων ψύλλων.
Η σελαμεκτίνη είναι ένα πολύ ισχυρό φάρμακο που χρησιμοποιείται για τον έλεγχο των ψύλλων, των τσιμπουριών, των εντερικών παρασίτων, των ακάρεων των αυτιών και της ασθένειας του σκουλήκι. Εφαρμόζοντας τοπικά, η σελαμεκτίνη απορροφάται στην κυκλοφορία του αίματος και στο γαστρεντερικό σωλήνα του ζώου και σκοτώνει σχεδόν όλους τους ψύλλους μέσα σε 36 ώρες από την εφαρμογή. Η σελαμεκτίνη είναι γνωστό ότι είναι ασφαλής για έγκυες και θηλάζουσες γυναίκες, σκύλους αναπαραγωγής και κολίους, αλλά δεν πρέπει να χορηγείται σε νεαρά ζώα ηλικίας μικρότερης των έξι εβδομάδων ή σε άρρωστα ή αδύναμα ζώα.
Αναστολείς ανάπτυξης εντόμων (IDI) και ρυθμιστές ανάπτυξης εντόμων (IGR) εμποδίζουν την ανάπτυξη ψύλλων. Τα IDIs αναστέλλουν την ανάπτυξη της χιτίνης, μιας ουσίας απαραίτητης για την ενηλικίωση. Οι IGR χρησιμοποιούν τη νεανική αυξητική ορμόνη για να αποτρέψουν την ωρίμανση του ψύλλου. Τα IDI και τα IGR δεν σκοτώνουν τους ψύλλους και συνήθως συνδυάζονται με ένα επιπλέον εντομοκτόνο. Αυτές οι χημικές ουσίες χρησιμοποιούνται συνήθως σε εκνεφωτές ή ψεκαστήρες ή ως στοματικά φάρμακα ή τοπικά σπρέι.
Ορισμένα από αυτά τα φάρμακα έχουν υψηλή τοξικότητα, έτσι τα φυσικά απωθητικά ψύλλων αυξάνονται. Τα εκχυλίσματα εσπεριδοειδών μπορούν να προστεθούν σε ντιπ, σαμπουάν και σπρέι και όπως και άλλα εντομοκτόνα, επηρεάζουν το νευρικό σύστημα των ψύλλων. Ορισμένα σκυλιά μπορεί να είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στα εκχυλίσματα εσπεριδοειδών. Το βορικό, συχνά με τη μορφή σκόνης βόρακα, αναστέλλει την ανάπτυξη εντόμων, αλλά οι μακροπρόθεσμες επιπτώσεις του είναι άγνωστες και έχει βρεθεί ότι είναι λιγότερο ασφαλές από τα IGR και τα IDI.