Οι πιο σημαντικοί παράγοντες που επηρεάζουν τη δοσολογία της κλονιδίνης είναι η υποκείμενη κατάσταση και η ανταπόκριση του ασθενούς στο φάρμακο. Ένα άλλο σημαντικό στοιχείο είναι η μορφή με την οποία χορηγείται το φάρμακο. Επιπλέον, η ηλικία ή η παρουσία άλλων ιατρικών καταστάσεων μπορεί να αλλάξει αυτό που οι γιατροί θεωρούν ως κατάλληλο ποσό.
Η κλονιδίνη θεραπεύει συχνότερα την υπέρταση, αλλά έχει και πολλές χρήσεις εκτός ετικέτας. Μπορεί να συνταγογραφηθεί για τη διαταραχή ελλειμματικής προσοχής και υπερκινητικότητα (ADHD), για διπολική διαταραχή ή ως προληπτικό μέσο για την ημικρανία. Εναλλακτικά, το φάρμακο μπορεί να θεραπεύσει τον πόνο ή να διευκολύνει την απόσυρση από το αλκοόλ, τα οπιούχα ή τις βενζοδιαζεπίνες. Δεδομένου ότι τα επιθυμητά αποτελέσματα ποικίλλουν, η δοσολογία της κλονιδίνης διαφέρει επίσης.
Για την υπέρταση, η τυπική αρχική δόση κλονιδίνης είναι 0.2 χιλιοστόγραμμα (mg) την ημέρα. Καθώς η θεραπεία συνεχίζεται, η αρτηριακή πίεση αξιολογείται τακτικά. Το φάρμακο μπορεί να αυξηθεί με ρυθμό 0.1 mg την εβδομάδα έως και 0.6 mg κάθε ημέρα. Σαφώς, η ανταπόκριση του ασθενούς είναι εξίσου σημαντική με την κατάσταση κατά τον καθορισμό της σωστής δόσης κλονιδίνης.
Τα παιδιά με ΔΕΠΥ που είναι μεγαλύτερα των έξι ετών μπορούν επίσης να λάβουν έως και 0.6 mg την ημέρα. Στις περισσότερες περιπτώσεις, θα χρησιμοποιούν πολύ λιγότερο από το φάρμακο. Ειδικά τα μικρότερα παιδιά μπορεί να αντιμετωπίζουν αποτελεσματικά τα συμπτώματά τους με 0.1 mg ημερησίως.
Η δοσολογία κλονιδίνης για τη διπολική διαταραχή και άλλες παθήσεις ψυχικής υγείας όπως οι αγχώδεις διαταραχές τείνει να είναι 0.2 mg ημερησίως. Για απόσυρση ουσίας, οι ασθενείς μπορεί να βρουν άνεση με 0.1-0.2 mg. Η πρόληψη της ημικρανίας συχνά επιτυγχάνεται και με 0.2 mg.
Οι δόσεις της κλονιδίνης μπορεί να διαφέρουν κάπως ανάλογα με το εάν είναι σε μορφή χαπιού ή επιθέματος. Τα επιθέματα δέρματος που περιέχουν το φάρμακο τείνουν να χορηγούν 0.1 mg την ημέρα. Δεδομένου ότι η χορήγηση είναι διαδερμική, το φάρμακο έχει μεγαλύτερη βιοδιαθεσιμότητα και αυτή η δόση θεωρείται ισοδύναμη με 0.2 mg που λαμβάνεται από το στόμα.
Όπως αποδεικνύεται από τις δοσολογικές ποσότητες σε μικρογραμμάρια, η κλονιδίνη είναι ένα ισχυρό φάρμακο. Σε ορισμένους πληθυσμούς, όπως στους ηλικιωμένους, η εισαγωγή του φαρμάκου σε 200 μικρογραμμάρια ή 0.2 mg μπορεί να προκαλέσει πάρα πολλές παρενέργειες. Ως γενική προσοχή, η θεραπεία με αυτό το φάρμακο σε ηλικιωμένους ασθενείς θα πρέπει να έχει πιο αργή περίοδο έναρξης. Ομοίως, η δοσολογία της κλονιδίνης σε άτομα με νεφρική (νεφρική) νόσο θα πρέπει συνήθως να ξεκινά αργά για να αποφευχθούν δυνητικά αρνητικές αντιδράσεις.
Ο χρόνος της δοσολογίας μπορεί επίσης να είναι σημαντικός. Οι πρώτες μέρες της κλονιδίνης μπορεί να προκαλέσουν δυσάρεστα συμπτώματα όπως ζάλη ή υπνηλία. Οι ασθενείς μπορεί να έχουν λιγότερες παρενέργειες εάν παίρνουν το φάρμακο τη νύχτα, όταν η προαγωγή της υπνηλίας είναι στην πραγματικότητα πλεονέκτημα. Ένα άλλο ζήτημα σχετικά με τη δοσολογία της κλονιδίνης είναι πώς να διακόψετε με ασφάλεια το φάρμακο, το οποίο μπορεί να προκαλέσει παρενέργειες εάν οι ασθενείς σταματήσουν απότομα να το παίρνουν. Συνιστάται η μείωση της δόσης για αρκετές ημέρες για την αποφυγή δυσάρεστων συμπτωμάτων.