Οι αμοιβές εμπειρογνωμόνων συχνά καθορίζονται μέσω διαπραγματεύσεων μεταξύ του εμπειρογνώμονα και του δικηγόρου που προσλαμβάνει τον εμπειρογνώμονα για λογαριασμό πελάτη. Οι αμοιβές που καταβάλλονται στους εμπειρογνώμονες για κατάθεση στο δικαστήριο ποικίλλουν. Μερικοί μάρτυρες χρεώνουν την ώρα ή την ημέρα. Σε ορισμένες δικαιοδοσίες, οι αμοιβές πραγματογνωμόνων ορίζονται από το νόμο. Ορισμένοι άλλοι παράγοντες που επηρεάζουν τις αμοιβές πραγματογνωμόνων, συμπεριλαμβανομένης της εμπειρογνωμοσύνης του μάρτυρα και των ειδών των παρεχόμενων υπηρεσιών.
Ορισμένοι επαγγελματίες ή εταιρείες ασχολούνται ειδικά με την πρόσληψη εαυτών ως ειδικών ως επάγγελμα πλήρους απασχόλησης. Για παράδειγμα, ορισμένες εταιρείες παρέχουν υπηρεσίες για την εξέταση οικονομικών εγγράφων για τον προσδιορισμό του εισοδήματος ενός ατόμου ή μιας επιχείρησης. Άλλες εταιρείες παρέχουν ειδικούς για την ανακατασκευή ατυχημάτων. Αυτές οι αμοιβές πραγματογνωμόνων θα είναι συνήθως υψηλότερες, καθώς οι εμπειρογνώμονες προσλαμβάνονται πλήρους απασχόλησης στην παροχή μαρτυριών εμπειρογνωμόνων και έχουν ιστορικό επιτευγμάτων σε προηγούμενες δικαστικές υποθέσεις.
Οι εταιρείες που ασχολούνται ειδικά με την παροχή υπηρεσιών εμπειρογνωμόνων θα διαπραγματεύονται συμβάσεις για τους διάφορους τύπους παρεχόμενων υπηρεσιών. Σε άλλες περιπτώσεις, οι τιμές είναι σταθερές. Αντίθετα, κάποιος που καταθέτει μόνο περιστασιακά ως πάρεργο στο κύριο επάγγελμα — όπως λογιστής ή μετεωρολόγος — μπορεί να χρεώσει μικρότερη αμοιβή. Τα ποσά που καταβάλλονται σε ένα πρόσωπο που υπηρετεί ως εμπειρογνώμονας εξαρτώνται συχνά από το ιστορικό του εμπειρογνώμονα και του δικηγόρου που διαπραγματεύεται τις αμοιβές.
Το εύρος των υπηρεσιών που παρέχει ένας πραγματογνώμονας θα επηρεάσει επίσης τον τρόπο καθορισμού των αμοιβών των πραγματογνωμόνων. Για παράδειγμα, ένας πραγματογνώμονας δεν περιορίζεται στην παροχή κατάθεσης στη δίκη. Ένας δικηγόρος μπορεί να χρειαστεί ο εμπειρογνώμονας να προετοιμάσει εκθέσεις ή να παρευρεθεί σε καταθέσεις για να βοηθήσει τον δικηγόρο να κατανοήσει τον εμπειρογνώμονα ενός αντιπάλου. Η κατάθεση είναι ένορκη μαρτυρία που δίνεται εκτός δικαστηρίου όπου ένας δικηγόρος έχει την ευκαιρία να ανακρίνει έναν αντίδικο και ορισμένους μάρτυρες που μπορούν να καταθέσουν στη δίκη. Σε περίπλοκες υποθέσεις, ένας δικηγόρος μπορεί να χρειαστεί τη βοήθεια ενός εμπειρογνώμονα για να παράσχει καταθέσεις κατάθεσης ή να εγείρει ερωτήσεις κατά τη διάρκεια αυτής της διαδικασίας.
Ο δικηγόρος που διαπραγματεύεται με έναν εμπειρογνώμονα για λογαριασμό ενός πελάτη θα ξέρει συνήθως πώς να δομήσει καλύτερα μια συμφωνία αμοιβής. Ο πελάτης, ωστόσο, είναι τελικά υπεύθυνος για την πληρωμή των αμοιβών πραγματογνωμόνων. Ένας πελάτης μπορεί να ρωτήσει τον δικηγόρο του γιατί χρειάζεται ένας συγκεκριμένος εμπειρογνώμονας και πόσο θα κοστίσει. Αυτό θα επιτρέψει στον πελάτη να κατανοήσει καλύτερα τη διαδικασία και να αποφύγει την πιθανότητα περιττών νομικών εξόδων.