Testarea genetică prenatală are mai multe avantaje și dezavantaje. În plus, permite planificarea posibilelor probleme de dezvoltare, determinarea viabilității fătului și stabilirea paternității. Pe partea negativă, prezintă un risc de a dăuna fătului și poate crește probabilitatea de avort spontan. De asemenea, testarea genetică nu este 100% exactă și poate cauza probleme emoționale femeii sau cuplului dacă se confruntă cu decizia de a întrerupe sarcina.
Testarea genetică prenatală poate oferi părinților informațiile necesare pentru a planifica orice nevoi speciale pe care le poate avea viitorul lor copil. Poate determina dacă sunt prezente defecte congenitale, cum ar fi o despicătură de buză sau spina bifida, oferind astfel părinților timp pentru a planifica opțiunile de tratament și posibilele intervenții chirurgicale. Pentru probleme de dezvoltare, cum ar fi sindromul Down și alte trisomii, cum ar fi sindromul Edward, testele genetice prenatale le oferă părinților timp să se pregătească pentru posibilitatea de a crește un copil cu o astfel de afecțiune.
În majoritatea sarcinilor, un făt care este incompatibil cu viața va pierde sarcina. Există însă unele cazuri în care sarcina continuă, indiferent de faptul că aproape sigur fătul va muri imediat după naștere. În aceste cazuri, testarea genetică prenatală poate fi de ajutor pentru a determina dacă este sigur sau benefic să duceți sarcina la termen, protejând astfel sănătatea mamei și protejând fătul de dureri inutile.
Un alt avantaj al testelor genetice prenatale este stabilirea paternității înainte de nașterea copilului. Acest lucru poate simplifica aranjamentele privind custodia și întreținerea copilului. Testarea genetică poate fi efectuată cu o amniocenteză relativ devreme în timpul sarcinii. ADN-ul adunat din acest test poate fi comparat cu ADN-ul posibililor tați pentru a determina cine este responsabil legal pentru copil.
Posibil unul dintre cele mai mari dezavantaje ale testării genetice prenatale este impactul emoțional pe care îl poate avea asupra ambilor părinți. Acest tip de testare le oferă adesea posibilitatea de a alege dacă să continue sau nu o sarcină. Pentru unii, acest lucru poate fi considerat un lucru bun. Cu toate acestea, poate crește șansele de traumă emoțională sau vinovăție, fie în ceea ce privește ducerea la termen, fie decizia de a înceta.
Deși testele genetice se îmbunătățesc în fiecare an, există încă anumite riscuri. Cele mai frecvente două teste genetice, vilozitatea cronică și amniocenteza, cresc riscul de avort spontan și, în unele cazuri, pot dăuna potențial fătului. De asemenea, acest tip de testare nu este întotdeauna precis. Fetușii diagnosticați cu anumite probleme se pot naște perfect sănătoși, iar cei despre care se crede că sunt sănătoși în uter poate să nu fie.