Cele mai comune subiecte de biochimie se încadrează în general în următoarele categorii: biochimia celulei vii, metabolismul, organismele animale sau vegetale, biochimia moleculară și genetica. În fiecare dintre aceste domenii, biochimiștii se concentrează pe studiul substanțelor chimice și al proceselor biochimice care apar în organismele vii. Studiul unei celule vii individuale este de obicei unul dintre cele mai comune subiecte de biochimie dintre toate.
Un motiv cheie pentru care cercetarea în biochimie se concentrează adesea pe chimia unei celule individuale este că există multe tipuri de procese chimice care sunt comune celulelor vii dintr-o gamă largă de organisme diferite, atât animale, cât și plante. Biologia celulară este cunoscută și sub numele de citologie, iar înțelegerea biochimiei unei celule stă la baza unei proporții foarte mari din celelalte subiecte de biochimie. O înțelegere a asemănărilor și diferențelor care există între diferitele tipuri de celule este de obicei foarte importantă pentru biochimiștii care studiază genetica, metabolismul și diverse domenii ale biochimiei animale, de exemplu.
Unii biochimiști preferă să clasifice subiectele de biochimie în funcție de chimia fundamentală implicată. O astfel de clasificare ar putea, de exemplu, să înceapă cu subiectele de bază ale structurii grăsimilor, structurii proteinelor și structurii carbohidraților. Odată ce structura de bază a principalelor molecule care sunt implicate în procesele biochimice a fost înțeleasă, atunci un studiu mai avansat poate explica funcțiile pe care diferitele molecule le îndeplinesc de obicei într-o celulă vie.
Subiectele de biochimie funcțională ar putea urma apoi de la subiectele de biochimie structurală sau de biologie moleculară. Acestea ar putea include subiecte precum legarea sau modul în care diferite molecule interacționează între ele; transport, adică modul în care moleculele se deplasează în și din celulele vii; cinetică sau transformări chimice; și semnalizarea sau modul în care celulele vii comunică între ele. Un biochimist care studiază pe această cale este probabil să construiască o bună pregătire în biochimie de bază, care poate fi apoi folosită pentru a se ramifica în diferite specializări diferite într-o carieră în biochimie.
Diferitele subiecte studiate într-un laborator de biochimie pot fi foarte variate. Înțelegerea blocurilor de bază ale vieții, celulele vii individuale, formează fundația pentru majoritatea, dacă nu pentru toate oportunitățile de angajare în biochimie și poate fi considerată punctul de plecare cheie pentru o carieră în biochimie. În ceea ce privește subiectele de biochimie, există, de asemenea, o suprapunere considerabilă între biochimie, biologie moleculară și alte domenii de studiu biologic.