Cele mai frecvente efecte secundare pentru apă de gură includ iritarea membranelor mucoase orale și senzația de arsură în gură. Gustul apei de gură poate persista ore întregi, făcând mâncarea să aibă un gust metalic, amar sau picant. Pentru a atenua efectul secundar de ardere a gurii, pot fi folosite arome mai subtile de apă de gură. Uneori, ingerarea unor cantități mari de apă de gură poate provoca reacții adverse mai severe. Acestea includ greață și vărsături, amețeli, diaree și amețeli.
Deși înghițirea accidentală a unor cantități mici de apă de gură nu este în general considerată gravă, consumul de apă de gură în mod deliberat poate provoca reacții adverse grave și poate chiar pune viața în pericol. Efectele secundare ale apei de gură pot include pierderea conștienței, convulsii și chiar stop cardiac din cauza conținutului ridicat de alcool prezent în anumite ape de gură. Aceste reacții adverse sunt similare cu cele resimțite atunci când se consumă cantități excesive de băuturi alcoolice.
Unul dintre cele mai tulburătoare efecte secundare pentru apă de gură este potențialul său de a crește riscul de cancer faringian și cancer oral. Acest lucru, din nou, se datorează conținutului ridicat de alcool al anumitor ape de gură. Deși ar putea fi necesare mai multe dovezi pentru a stabili o legătură certă, poate fi prudent să folosiți o apă de gură fără alcool. Alte efecte secundare pentru apă de gură includ iritarea și desprinderea țesuturilor bucale, ceea ce este inconfortabil și poate pregăti scena pentru o infecție orală sau chiar o boală a gingiilor.
Beneficiile apei de gură includ capacitatea sa de a reduce bacteriile orale care pot duce la boli ale gingiilor și infecții dentare. Apa de gură poate ajuta, de asemenea, la eliminarea plăcii și a respirației urât mirositoare. Persoanele care folosesc apă de gură sau clătiri care conțin fluor pot fi mai puțin expuse riscului de a dezvolta carii. Anumite ape de gură pot, de asemenea, să calmeze durerea în gât. Gargara cu apă de gură poate ajuta la ameliorarea durerii în gât cauzată de o infecție, totuși, gargara prea des cu o apă de gură pe bază de alcool poate contribui la durere.
Un medic stomatolog trebuie consultat atunci când apar efecte secundare pentru apă de gură. El poate evalua afectarea țesutului bucal și poate discuta despre igiena orală folosind ape de gură fără alcool. Unii profesionisti din domeniul stomatologic, insa, nu recomanda deloc folosirea apei de gura, recomandand in schimb un program bun de igiena orala care sa includa periajul dintilor de cel putin doua ori pe zi si folosirea atei dentare intre mese.