Printre diferitele sarcini care sunt gestionate cu ajutorul instrumentelor Linux se numără monitorizarea sistemului, configurarea și controlul rețelei, administrarea sistemului, managementul software-ului, instalarea sistemului, securitatea, dezvoltarea software-ului și imprimarea. Instrumentele Linux pot fi accesibile într-o interfață grafică cu utilizatorul (GUI), într-un shell sau în oricare mediu. Ele diferă și prin faptul că unele instrumente sunt specifice anumitor distribuții. De exemplu, anaconda, un instrument de instalare scris în limbajul de programare python, este adesea folosit de noii utilizatori ai distribuției Fedora care instalează sistemul de operare prin pornirea de pe discurile compacte (CD-uri) de instalare sau de pe un disc digital versatil (DVD).
Instrumentele Linux pentru monitorizarea sistemului sunt folosite pentru a îndeplini sarcini precum afișarea memoriei de sistem libere și utilizate în kiloocteți și raportarea proceselor și a activității unității centrale de procesare (CPU). Așa cum unele instrumente Linux sunt specifice distribuției, ele pot fi specifice unui anumit mediu desktop. Majoritatea distribuțiilor vin cu o varietate de instrumente pentru configurarea, gestionarea, controlul și monitorizarea unui număr de dispozitive hardware, pachete software și procese, ceea ce este important pentru securitatea și stabilitatea sistemului. Instrumentele de configurare a rețelei sunt folosite pentru a configura și controla noul hardware, cum ar fi o placă de interfață de rețea (NIC), pentru a se conecta la o rețea fără fir și chiar pentru a depana problemele de conexiune la rețea.
Instrumentele de administrare a sistemului sunt folosite pentru a seta funcționalitatea pentru sunet, configura încărcătorul de pornire, pentru a schimba data și ora sistemului, pentru a efectua actualizări ale sistemului de operare, pentru a gestiona volume logice, a gestiona utilizatorii sistemului și a gestiona grupuri, printre alte sarcini. Gestionarea software-ului este gestionată de instrumente Linux, cum ar fi programul de actualizare Yellowdog modificat (YUM) și managerul de pachete red hat (RPM). Acestea sunt instrumente de linie de comandă. Multe distribuții oferă și instrumente GUI pentru gestionarea software-ului, care implică instalarea, modificarea și eliminarea pachetelor.
Dezvoltarea și modificarea software-ului pot fi realizate mai ușor folosind instrumente Linux, cum ar fi compilatoare pentru limbajul de programare C/C++ și Iced Tea pentru codare în JAVA, pentru a permite compilarea și rularea programului în mașina virtuală. Securitatea poate fi îmbunătățită folosind instrumente pentru configurarea unui firewall, securitate îmbunătățită (SE) Linux și parole de încărcare. Sistemul comun de imprimare UNIX (CUPS) este un instrument folosit pentru a configura și controla imprimantele locale și în rețea, precum și coada de imprimare. Deși multe instrumente Linux sunt grafice, unele foarte importante sunt doar pe linia de comandă și chiar și cele care sunt grafice ar putea să nu fie complet funcționale într-o interfață grafică.