Există un număr mare de instrumente de dezvoltare Java® disponibile pentru aproape toate etapele dezvoltării software, de la implementare până la implementare. Aceste instrumente sunt capabile să profileze complet aplicațiile care rulează, să dezasambla clasele compilate și chiar să creeze legături speciale la biblioteci scrise în alte limbi decât Java®. Mediile de dezvoltare integrate (IDE) implementează multe dintre aceste instrumente și adaugă alte funcții convenabile care pot face programarea și depanarea mai ușoare decât utilizarea unei linii de comandă. Varietatea și volumul instrumentelor de dezvoltare Java® este rezultatul că limbajul este open source, ceea ce permite dezvoltatorilor acces ușor la funcționarea interioară a implementărilor de bază atunci când creează instrumente.
Majoritatea instrumentelor disponibile sunt utile în timpul fazei de implementare a dezvoltării. Unele instrumente disponibile pot analiza execuția unui program și pot izola zonele din codul sursă în care se petrece cel mai mult timp de procesare. De asemenea, pot găsi blocuri de cod neutilizate care nu sunt accesibile de către programul principal. Au fost scrise instrumente speciale pentru dezvoltatori Java® care sunt capabile să arate starea memoriei în timp real pe măsură ce evoluează în timpul execuției.
Există instrumente de sine stătătoare care pot fi folosite pentru a crea o întreagă interfață de utilizator prin simpla glisare și plasare a componentelor prefabricate. Componentele nici măcar nu trebuie să fie strict vizuale, ci în schimb pot fi clase de control. Acest tip de dezvoltare rapidă a aplicațiilor permite programatorilor să creeze elemente mici, personalizabile, care sunt ușor de reutilizat din nou și din nou, oferind funcționalitate consecventă.
IDE-urile Java® sunt instrumente foarte eficiente pentru depanarea programelor. Pe lângă faptul că pot trata fără probleme codul sursă pentru bibliotecile de bază Java® ca și cum ar fi parte din proiectul curent, IDE-urile pot oferi, de asemenea, urme detaliate ale stivei și abilități de navigare în clasă. IDE-urile pot folosi instrumente suplimentare care permit urmărirea revizuirilor și versiunea fișierelor, astfel încât modificările nedorite să poată fi eliminate și fișierele sursă restaurate la o stare funcțională.
Există și o varietate de emulatoare de sistem disponibile. Aceste instrumente pentru dezvoltatori Java® pot simula mediul de rulare al unui dispozitiv portabil, un anumit sistem de operare sau browser web. Emulatoarele permit dezvoltării să aibă loc pe un sistem desktop fără a fi nevoie de a transfera constant programe pe dispozitivul țintă real pentru testare.
Implementarea poate fi simplificată prin utilizarea protocolului de lansare a rețelei Java® (JNLP). Acest lucru permite unui program să fie complet instalat și implementat pe un sistem gazdă printr-o conexiune la rețea. Întreținerea programelor viitoare poate fi ajutată cu JNLP prin furnizarea unui cadru pentru actualizările automate ale programului.