Majoritatea chisturilor ovariene dispar de la sine și, prin urmare, nu necesită intervenție chirurgicală. Cele care necesită îndepărtarea chirurgicală sunt de obicei mari, canceroase, extrem de dureroase sau solide. În timpul intervenției chirurgicale, se va face o incizie, chistul va fi îndepărtat, iar țesutul va fi testat dacă se suspectează cancer. Se vor folosi fie capse, fie cusături pentru a închide zona și se vor oferi medicamente pentru durere pentru a trata disconfortul abdominal care vine de obicei cu acest tratament. În timp ce operația de chist ovarian durează de obicei doar câteva ore, spitalizarea este de obicei de cel puțin trei zile, urmată de o perioadă de recuperare de până la patru săptămâni.
Acest tip de tratament pentru chisturile ovariene este de obicei o ultimă soluție, deoarece există riscuri care vin cu orice intervenție chirurgicală, deși sunt încă destul de rare. Este posibil ca pacienții să se confrunte cu complicații cum ar fi sângerare excesivă, infecție, infertilitate, cheaguri de sânge și necesitatea de a elimina ovarele, motiv pentru care chirurgia chistului ovarian nu este de obicei primul tratament oferit. Înainte de programarea intervenției chirurgicale, majoritatea medicilor efectuează un examen fizic, ecografie, tomografie computerizată și analize de urină și sânge, pentru a numi câteva dintre analizele comune necesare. În plus, medicamentele care diluează sângele și medicamentele antiinflamatoare cum ar fi aspirina ar trebui întrerupte temporar, deoarece pot provoca un efect advers după operația cu chistul ovarian.
Majoritatea medicilor folosesc anestezia generală pentru a bloca durerea operației și apoi procedează prin tăierea în abdomen. Mușchii din zonă sunt mai întâi separați, iar vasele de sânge sunt apoi îndepărtate, astfel încât medicul să poată îndepărta chistul. Dacă se suspectează cancer, un țesut poate fi, de asemenea, îndepărtat în acest moment, pentru a putea fi testat. Mușchii abdominali sunt apoi de obicei cusuți, iar incizia inițială este de obicei închisă fie cu capse, fie cu cusături. În cele din urmă, lichidele și medicamentele sunt administrate intravenos direct după operația chistului ovarian.
Deși durerea abdominală ar trebui să dispară în aproximativ zece zile, perioada de recuperare poate dura până la patru săptămâni. În acest timp, incizia trebuie curățată în mod regulat cu apă și săpun, iar picioarele trebuie mișcate cu grijă, ca de obicei, pentru a preveni formarea cheagurilor de sânge. În cele mai multe cazuri, pacienții pot reveni la rutina lor tipică atunci când se simt în măsură, deși activitatea intensă ar trebui evitată timp de până la șase săptămâni. Majoritatea medicilor își informează pacienții când s-au vindecat complet după operația cu chistul ovarian și pot reveni la activitățile lor obișnuite.