Mulți proprietari de animale de companie pot fi surprinși de comportamentul noilor lor cobai, dar, de obicei, nu durează mult până când animalele se relaxează într-un mediu nou. Comportamentul tipic de cobai, mai ales când este tânăr, implică adesea fuga la cea mai mică mișcare. Cobaii sar, de asemenea, când sunt fericiți și fac un pui de somn scurt pe parcursul unei zile. Comportamentul agresiv de a exercita o dominație este obișnuit printre cobaii nou introduși.
Porcușorii de Guineea – cunoscuți și sub denumirea de cavies, datorită numelui lor științific, Cavia porcellus – sunt animale de pradă în sălbăticie, ceea ce înseamnă că sunt în mod natural precauți și ușor de speriat. Comportamentul obișnuit al cobaiului, în special atunci când este tânăr sau intră în împrejurimi noi, este acela de a petrece mult timp ascunzându-se. Până când cavy devine mai încrezător, este probabil să fugă și să se ascundă la cel mai mic zgomot. Acest lucru îi poate îngrijora pe noii stăpâni, care uneori cred că cobaiul lor nu va dori niciodată să fie ridicat, dar acest comportament este de fapt un semn al unui animal de companie sănătos și alert.
Când un cobai este fericit, poate „floricele”. Un cobai „popcorning” sare sus în aer, o mișcare uneori însoțită de sprinting în jurul cuștii sale. Poate chiar să pară că are o criză minoră. Acest lucru poate fi, de asemenea, deconcertant pentru un nou proprietar, dar este un comportament normal de cobai care arată că animalul este fericit sau entuziasmat.
Cobaii nu dorm perioade lungi de timp. În schimb, animalele tind să fie treaz timp de o oră și apoi să se odihnească timp de o oră înainte de a repeta ciclul. Majoritatea porcușorilor de Guineea nu par că dorm de fapt, pentru că de multe ori ochii lor nu se închid complet. Acest lucru se datorează faptului că un cavy în sălbăticie trebuie să fie în permanență alertă, chiar și atunci când se odihnește.
Una dintre cele mai interesante fațete ale comportamentului cobaiului este modul în care animalele comunică. Porcușorii de Guineea folosesc o varietate de zgomote pentru a da avertismente, pentru a arăta fericire și pentru a cerși mâncare. Când animalele sunt ținute împreună, ele vor încerca să stabilească o ierarhie, adesea prin comportamentul cobaiului cunoscut sub numele de rumble strutting. Un zgomot de cobai care se lăvănă scoate un zgomot adânc în timp ce își legănă încet șoldurile înainte și înapoi. Aceasta este o încercare de a exercita o dominație asupra altor cobai.
Majoritatea cobaii mușcă rar sau manifestă agresivitate față de oameni. Totuși, dacă o cavy începe să clănțăne din dinți, atunci acesta este un avertisment pentru alt cobai sau om să țină departe. Nerespectarea acestui lucru va duce adesea la o mică mușcătură de avertizare. Porcusorii de Guineea pot, de asemenea, să clănțăne din dinți atunci când încearcă să afle care animal de companie este cel dominant.