Creierul uman este compus din patru regiuni majore: trunchiul cerebral, cerebelul, diencefalul și creierul. Situat aproape de centrul creierului, diecefalul este compus din hipotalamus, talamus și epitalamus. Dintre cele trei secțiuni care alcătuiesc diecefalul, epitalamusul este cel dorsal sau cel mai îndepărtat în spate. Din punct de vedere al funcției, epitalamusul este responsabil de conectarea sistemului limbic cu restul creierului, precum și de reglarea hormonilor secretați de glanda pineală.
Privind o vedere laterală a creierului uman, epitalamusul este situat chiar deasupra medulei oblongate și a glandei pituitare. Urmând calea măduvei spinării în craniu, cordonul trece în creier prin medula oblongata, terminându-se în secțiunea inferioară a creierului mijlociu. Chiar deasupra și câțiva centimetri înainte, glanda pituitară se sprijină pe o axă orizontală cu ochii și urechile. Epitalamusul și componentele sale asociate se extind atât peste medulara oblongata, cât și pe glanda pituitară.
Structurile din epitalamus includ habenula, stria medulară și corpul pineal sau glanda pineală. Cercetătorii nu înțeleg pe deplin toate funcțiile diferitelor structuri din epitalamus, deși unele funcții sunt evidente. De exemplu, cercetătorii știu că glanda pineală, situată în spatele epitalamusului, este responsabilă de reglarea ritmurilor circadiene. Melatonina, hormonul responsabil pentru somnolență, este secretată de glanda pineală atât la oameni, cât și la mamifere pentru a induce cicluri normale de somn.
Cunoscut ca „al treilea ochi”, corpul pineal participă și la alte funcții ale corpului. Nu mai mare decât un singur bob de orez, producția de melatonină de către mica glanda pineală inhibă, de asemenea, dezvoltarea sexuală atât la oameni, cât și la animale până la adolescență. Emoțiile și anumite căi motorii sunt, de asemenea, influențate, din cauza asemănărilor strânse dintre melatonină și serotonină.
Lângă glanda pineală se află habenula, cunoscută și sub denumirea de nuclei habenulari. Oamenii de știință cred că habenula este implicată în reglarea aportului organismului de nutrienți și apă. În plus, cercetările indică că habenula conține fibre care conectează stria medulară cu alte părți ale creierului implicate în eliberarea de serotonine, dopamină și norepinefrină.
Proiectând înapoi spre nucleii habenulari se află stria medulară a talamusului. Se cunosc puține lucruri despre stria medulară, în afară de faptul că este un mănunchi de fibre nervoase eferente sau senzoriale structurate pentru a forma o creastă între talamus și epitalamus. Unele baze de date de anatomie listează stria medulară ca parte a talamusului, în timp ce altele o listează ca parte a epitalamusului.