Ένα μαγνητόμετρο πρωτονίων ή ένα μαγνητόμετρο μετάπτωσης πρωτονίων είναι μια συσκευή που μπορεί να μετρήσει τις διακυμάνσεις σε ένα μαγνητικό πεδίο ανιχνεύοντας δραστηριότητα στα πρωτόνια. Αυτές οι συσκευές χρησιμοποιούνται σε πολλές εφαρμογές στη Γη και επίσης στην εξερεύνηση του διαστήματος. Χρησιμοποιώντας ένα μαγνητόμετρο πρωτονίων, μπορούν να αναγνωριστούν σιδηρούχα υλικά, επειδή επηρεάζουν το μαγνητικό πεδίο γύρω τους, ενεργοποιώντας με τη σειρά τους το ευαίσθητο μαγνητόμετρο πρωτονίων. Τέτοιες συσκευές μπορούν να συνδεθούν με έναν μαγνητογράφο ο οποίος παρέχει μια τυπωμένη έξοδο διακυμάνσεων στο μαγνητικό πεδίο που μελετάται.
Μια εφαρμογή του μαγνητομέτρου πρωτονίων είναι στην αρχαιολογία. Τα σιδηρούχα υλικά έχουν αξιοποιηθεί από πολλές ανθρώπινες κοινωνίες κατά τη διάρκεια της ιστορίας και οι τοποθεσίες αρχαιολογικού ενδιαφέροντος μπορούν να εντοπιστούν αναζητώντας τέτοια υλικά. Οι ανθρώπινες δραστηριότητες που οι άνθρωποι μπορεί να μην συσχετίζονται αμέσως με σιδηρούχα υλικά, όπως η ανάπτυξη γλάσων κεραμικής και η γεωργία, μπορούν επίσης να δημιουργήσουν διακυμάνσεις στο μαγνητικό πεδίο της Γης που λειτουργούν ως ενδεικτικά σημάδια της ανθρώπινης δραστηριότητας.
Αυτές οι συσκευές χρησιμοποιούνται επίσης στην εξερεύνηση ορυκτών για τον εντοπισμό τοποθεσιών ενδιαφέροντος. Τα σιδηρούχα υλικά από μόνα τους μπορεί να είναι πολύτιμα και μπορούν επίσης να συσχετιστούν με άλλα υλικά που μπορεί να ενδιαφέρουν μια επιχείρηση που ασχολείται με δραστηριότητες εξόρυξης ορυκτών. Σε αυτή την περίπτωση, το μαγνητόμετρο πρωτονίων μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να μειώσει τις εικασίες που εμπλέκονται στην εξερεύνηση μιας τοποθεσίας που πιστεύεται ότι περιέχει υλικά ενδιαφέροντος.
Τα πλοία ενδέχεται να είναι εξοπλισμένα με μαγνητόμετρο πρωτονίων για λόγους ασφάλειας της ναυσιπλοΐας, καθώς είναι δυνατό να συγκρουστούν με ναυάγια και άλλα σιδηρούχα αντικείμενα και να προκληθούν ζημιές. Οι άνθρωποι που προσπαθούν να εντοπίσουν ναυάγια για διάσωση, καταδύσεις αναψυχής και άλλες δραστηριότητες χρησιμοποιούν επίσης αυτές τις συσκευές στην εργασία τους. Το επίπεδο πολυπλοκότητας της συσκευής ποικίλλει, ανάλογα με τη χρήση για την οποία έχει σχεδιαστεί. Οι εξαιρετικά ευαίσθητες εκδόσεις μπορεί να είναι αρκετά δαπανηρές, αντανακλώντας την πιο σύνθετη μηχανική που εμπλέκεται στην ανάπτυξή τους.
Η Γη δεν είναι το μόνο μέρος όπου ένα μαγνητόμετρο πρωτονίων μπορεί να είναι χρήσιμο. Τα διαστημικά σκάφη όπως οι ανιχνευτές είναι συχνά εξοπλισμένα με μαγνητόμετρα πρωτονίων, έτσι ώστε να μπορούν να συλλέγουν δεδομένα για τους πλανήτες και άλλους σχηματισμούς που περνούν. Αυτές οι πληροφορίες μπορούν να συνδυαστούν με άλλες πληροφορίες που συλλέγονται από το διαστημόπλοιο για να παρέχουν στους ερευνητές περισσότερες πληροφορίες σχετικά με αντικείμενα στο διάστημα και την ιστορία του διαστήματος. Η σύνθεση των εδαφών και των ατμοσφαιρών είναι επίσης ένα θέμα ενδιαφέροντος μεταξύ των ερευνητών που ενδιαφέρονται για τη δυνατότητα ταυτοποίησης της ζωής σε άλλες γωνιές του σύμπαντος.