Η διαπνοή είναι η διαδικασία της εξάτμισης του νερού μέσω της στομίας, ή των πόρων, στο φύλλωμα των φυτών. Το νερό ταξιδεύει από τις ρίζες όπου απορροφάται, προς τα πάνω μέσω του μίσχου, και εξέρχεται ως ατμός από μικροσκοπικές τρύπες στο κάτω μέρος των φύλλων του φυτού. Αυτή η διαδικασία μπορεί να είναι επιζήμια για τα φυτά, ειδικά όταν η ποσότητα του διαθέσιμου νερού είναι χαμηλή, αλλά είναι ζωτικής σημασίας για την παραγωγή τροφής. Περίπου το 10% του νερού στην ατμόσφαιρα παράγεται με αυτόν τον τρόπο, ενώ το υπόλοιπο 90% είναι αποτέλεσμα της εξάτμισης.
Ο κύριος σκοπός της διαπνοής είναι να ανοίξει η στομία, επιτρέποντας στο διοξείδιο του άνθρακα να διαχέεται στον αέρα, η οποία είναι μια κύρια λειτουργία της φωτοσύνθεσης. Το υγρό που απελευθερώνεται εμφανίζεται ως παρενέργεια. Η πίεση του νερού στα φύλλα του φυτού είναι σημαντικά χαμηλότερη από αυτή στις ρίζες, με αποτέλεσμα να κινείται προς τα πάνω. Το νερό είναι πλούσιο σε θρεπτικά συστατικά και συνδυάζεται με το ηλιακό φως και το διοξείδιο του άνθρακα στα φύλλα. Αυτό δημιουργεί τροφή για το φυτό και η στομία στα φύλλα στη συνέχεια ανοίγει, επιτρέποντας στο υπόλοιπο νερό και το διοξείδιο του άνθρακα να απελευθερωθεί στην ατμόσφαιρα.
Ένα μέσο δέντρο βελανιδιάς θα απελευθερώνει περίπου 40,000 γαλόνια (151,416 λίτρα) νερού ετησίως, ενώ ένα χωράφι με καλαμπόκι θα εκπέμπει μεταξύ 3,000 και 4,000 γαλόνια (11,356 και 15,141 λίτρα) νερού την ημέρα. Άλλα φυτά, ειδικά ιθαγενείς της ερήμου, προσαρμόζονται για να μειώνουν την ποσότητα υγρασίας που απελευθερώνουν, σε μια προσπάθεια εξοικονόμησης νερού. Οι κάκτοι πραγματοποιούν φωτοσύνθεση στους μίσχους τους, με αποτέλεσμα ένα σχετικά μικρό αριθμό στομίων. Άλλα φυτά που είναι εξειδικευμένα για τη μείωση της απώλειας νερού έχουν μια ειδική μορφή φωτοσύνθεσης που κάνει τη στομία να κλείνει κατά τη διάρκεια της ζεστής ημέρας, όταν χρειάζεται περισσότερο νερό, και να ανοίγει τη νύχτα, όταν η ποσότητα του νερού που διαχέεται θα είναι μικρότερη.
Τα φύλλα δεν μπορούν να διαβρωθούν όταν η υγρασία του αέρα που περιβάλλει απευθείας τη στομία είναι υψηλή. Όταν ο αέρας είναι ήδη κορεσμένος με νερό, περισσότερο νερό δεν μπορεί να διαχυθεί στους πόρους του φυτού, καθώς δεν έχει πού να πάει. Ο άνεμος παίζει επίσης ζωτικό ρόλο στη διαπνοή. Καθώς ο αέρας γύρω από τη στομία γίνεται κορεσμένος με νερό, ο άνεμος τον φυσά μακριά και αντικαθίσταται με πιο ξηρό αέρα, ο οποίος μπορεί να κρατήσει επιπλέον νερό, επιτρέποντας στο φυτό να διαπνέει.
Η θερμοκρασία επηρεάζει επίσης τον ρυθμό με τον οποίο συμβαίνει η απελευθέρωση του νερού. Όταν ο αέρας είναι πιο ζεστός, η στομία ανοίγει, επιτρέποντας στο φυτό να διαβρώσει περισσότερο. Κατά τη διάρκεια του κρύου καιρού, η στομία παραμένει κλειστή και δεν απελευθερώνει τόσο πολύ νερό. Η καλλιεργητική περίοδος συμβαίνει κατά τους θερμότερους μήνες, επειδή η φωτοσύνθεση μπορεί να πραγματοποιηθεί πιο συχνά, καθώς οι στομοί είναι ανοιχτοί για μεγαλύτερα χρονικά διαστήματα και μπορεί να δημιουργηθεί περισσότερη τροφή. Τα φυτά συχνά αδρανούν κατά τη διάρκεια του χειμώνα, λόγω των χαμηλότερων θερμοκρασιών και του παρατεταμένου κλεισίματος της στομίας.