Τα εντομοκτόνα είναι σε κοινή χρήση στη γεωργία καθώς και σε πληθυσμούς φυτών εσωτερικού χώρου, κήπους και άλλους χώρους διαβίωσης σε μια προσπάθεια να ελεγχθεί η εισβολή μιας φαινομενικά ατελείωτης σειράς εντόμων. Η χρήση εντομοκτόνων λειτουργεί για να κρατήσει τους πληθυσμούς υπό έλεγχο, αλλά με την πάροδο του χρόνου τα έντομα μπορούν να δημιουργήσουν αντίσταση στις χημικές ουσίες που χρησιμοποιούνται. Αυτό ονομάζεται αντίσταση στα εντομοκτόνα. Η αντοχή στα εντομοκτόνα είναι εμφανής όταν ένας πληθυσμός σταματά να ανταποκρίνεται ή δεν ανταποκρίνεται το ίδιο καλά σε εφαρμογές εντομοκτόνων.
Συχνά τα έντομα αναπτύσσουν γενετικές αλλαγές που τους επιτρέπουν να αντέχουν τις εφαρμογές εντομοκτόνων. Κάθε φορά που χρησιμοποιείται ένα εντομοκτόνο, είναι απίθανο να εξαφανιστούν όλα τα μέλη του πληθυσμού. Όσοι στον πληθυσμό αναπτύσσουν μια κληρονομήσιμη αλλαγή μπορούν να τη μεταδώσουν στις μελλοντικές γενιές σε σταδιακά αυξανόμενους αριθμούς. Καθώς κάθε γενιά παράγει περισσότερα άτομα που είναι ανθεκτικά στις χημικές ουσίες, η συνολική αποτελεσματικότητα των εφαρμογών μπορεί να φανεί ότι μειώνεται. Οι πληθυσμοί εντόμων που αναπαράγονται γρήγορα μπορούν να παρουσιάσουν ανθεκτικότητα σε σύντομο χρονικό διάστημα.
Το DDT, που αναπτύχθηκε στις αρχές της δεκαετίας του 1940, εργάστηκε για την εξάλειψη των περισσότερων παρασίτων, αλλά στα τέλη της δεκαετίας του 1940, οι πληθυσμοί των εντόμων είχαν ήδη αρχίσει να παρουσιάζουν σημάδια ανάπτυξης αντοχής στα εντομοκτόνα. Σύμφωνα με την Επιτροπή Δράσης για την Αντίσταση στα Εντομοκτόνα (IRAC), οι πληθυσμοί έχουν αναπτύξει σημάδια αντοχής σε όλες τις νέες κατηγορίες εντομοκτόνων, συμπεριλαμβανομένων των φορμαμιδινών, των κυκλοδιενίων, των καρβαμιδικών, των πυρεθροειδών και των οργανοφωσφορικών.
Σε περιορισμένους χώρους όπως τα θερμοκήπια, η αντοχή στα εντομοκτόνα συνήθως περιορίζεται σε μία περιοχή και δεν αλλάζει τη γενετική των γύρω πληθυσμών εντόμων. Όμως, τα ιπτάμενα έντομα και οι πληθυσμοί που επιδεικνύουν μεταναστευτική συμπεριφορά κάνουν την εξάπλωση του αλλοιωμένου γενετικού υλικού μια πιθανή πραγματικότητα. Αυτό αναγκάζει τις χημικές εταιρείες να συνεχίσουν να αναπτύσσουν νέα φυτοφάρμακα στα οποία οι πληθυσμοί των εντόμων δεν είναι ακόμη ανθεκτικοί, προκειμένου να καταπολεμήσουν τα παράσιτα στις καλλιέργειες και τους κήπους.
Ένας απλούστερος τρόπος με τον οποίο οι πληθυσμοί των εντόμων αναπτύσσουν αντοχή σε ένα φυτοφάρμακο είναι να αναπτύξουν συμπεριφορά που τους επιτρέπει να αποφύγουν το δηλητήριο. Μερικά έντομα θα απομακρυνθούν από την πληγείσα περιοχή και θα κρυφτούν σε μη επεξεργασμένο φύλλωμα ή κοντά στο κέντρο του φυτού όπου το εντομοκτόνο δεν εφαρμόστηκε καλά. Μερικά ιπτάμενα έντομα θα εγκαταλείψουν απλώς μια περιοχή που έχει υποστεί επεξεργασία και θα επιστρέψουν όταν το εντομοκτόνο έχει φθαρεί.
Υπάρχουν διάφοροι τρόποι για να αποφύγετε την αντοχή στα εντομοκτόνα. Διαφορετικά εντομοκτόνα πρέπει να χρησιμοποιούνται εναλλάξ, έτσι ώστε οι πληθυσμοί να μην αναπτύσσουν αντοχή σε καμία χημική ουσία. Άλλες μέθοδοι καταπολέμησης των εντόμων, όπως η χρήση εντομοκτόνων ελαίων και σαπουνιών, μπορεί να είναι λιγότερο πιθανό να οδηγήσουν σε αντίσταση στα έντομα.