Η κύρια λειτουργία του ενσωματωμένου συστήματος είναι να παρέχει ένα προστατευτικό κάλυμμα για το σώμα. Αυτό το σύστημα περιλαμβάνει το δέρμα και τις σχετικές δομές, όπως τρίχες, ιδρωτοποιούς και λιπώδεις αδένες και τα νύχια. Σχηματίζει φράγμα ενάντια σε θερμές και κρύες θερμοκρασίες, επιβλαβείς χημικές ουσίες και ηλιακή ακτινοβολία, καθώς και μικροοργανισμούς. Επιπλέον, έχει σημαντικό ρόλο στην αίσθηση της αφής και βοηθά στη διατήρηση της θερμοκρασίας του σώματος. Ομοίως, το ολοκληρωμένο σύστημα είναι σημαντικό για την παραγωγή βιταμίνης D και παίζει μικρό ρόλο στην αποβολή των αποβλήτων.
Αυτό το σύστημα είναι η πρώτη άμυνα του οργανισμού έναντι βλάβης ή τραυματισμού. Το δέρμα προστατεύει τα εσωτερικά όργανα και άλλες δομές από τραυματισμούς που προκαλούνται από τριβή, όπως γρατζουνιές ή κοψίματα. Διατηρεί επίσης τους μικροοργανισμούς, όπως τα βακτήρια. Τα μαλλιά μονώνουν το σώμα, το προστατεύουν από το φως του ήλιου και κρατούν τα ερεθιστικά μακριά από τα μάτια, μεταξύ άλλων. Τα νύχια αποτρέπουν τραυματισμούς στα άκρα των δακτύλων και των ποδιών.
Το δέρμα είναι επίσης σημαντικό για τη διατήρηση της εσωτερικής θερμοκρασίας του σώματος. Η εξάτμιση του ιδρώτα από το δέρμα απαιτεί θερμότητα, η οποία βοηθά στην ψύξη του σώματος. Αυτό μπορεί να είναι έως και 2 γαλόνια (7.5 λίτρα) ή περισσότερο σε ακραίες συνθήκες. Όταν η θερμοκρασία του σώματος αυξάνεται, η ροή του αίματος αυξάνεται επίσης στο δέρμα, όπου η υπερβολική θερμότητα χάνεται μέσω της μεταφοράς. Σε ψυχρότερα περιβάλλοντα, η ροή αίματος στο δέρμα μειώνεται, γεγονός που μειώνει την απώλεια θερμότητας.
Η παροχή πληροφοριών σχετικά με το περιβάλλον ενός οργανισμού είναι επίσης μια σημαντική λειτουργία του ολοκληρωμένου συστήματος. Οι νευρικές απολήξεις στο δέρμα επιτρέπουν στο σώμα να αισθανθεί αλλαγές θερμοκρασίας, πίεση και αφή. Το ανώτερο στρώμα περιέχει τους υποδοχείς που είναι υπεύθυνοι για την αίσθηση της αφής, ενώ εκείνοι στο κάτω στρώμα του δέρματος μπορούν να αισθανθούν θερμότητα και κρύο, πίεση και πόνο. Τα θυλάκια τρίχας, αλλά όχι τα ίδια τα μαλλιά, ανταποκρίνονται επίσης στο άγγιγμα.
Βοηθώντας το σώμα να παράγει βιταμίνη D είναι ένας σημαντικός ρόλος του δέρματος. Μέρος της διαδικασίας συμβαίνει όταν το υπεριώδες φως από τον ήλιο χτυπά πρόδρομα μόρια στο δέρμα. Τα μεταβαλλόμενα μόρια μετατρέπονται αργότερα σε ενεργή μορφή βιταμίνης D στα νεφρά και το ήπαρ. Το σώμα μπορεί να παράγει όλη την απαραίτητη βιταμίνη D με αυτόν τον τρόπο, υπό την προϋπόθεση ότι υπάρχει αρκετό ηλιακό φως.
Μια μικρότερη λειτουργία του συστήματος είναι η αποβολή απορριμμάτων. Ο ιδρώτας είναι σχεδόν όλο νερό, αλλά περιέχει μικρές ποσότητες απορριμμάτων, όπως ουρία, ουρικό οξύ και αμμωνία. Άλλα όργανα, όπως τα νεφρά, παίζουν πολύ μεγαλύτερο ρόλο στην απαλλαγή του σώματος από τα απόβλητα.