Τι είναι η ολική απομόνωση RNA;

Η απομόνωση ολικού ριβονουκλεϊκού οξέος (RNA) είναι μια εργαστηριακή τεχνική που χρησιμοποιείται για την εξαγωγή όλου του κυτταρικού RNA από ένα δείγμα ιστού. Αυτό διαφέρει από άλλες μεθόδους επεξεργασίας που εξάγουν επιλεκτικά ορισμένους τύπους RNA. Ένας ερευνητής μπορεί, για παράδειγμα, να θέλει να επιθεωρήσει το αγγελιοφόρο RNA (mRNA) και θα μπορούσε να εργαστεί με ένα δείγμα για να εξαγάγει μόνο αυτό το γενετικό υλικό. Υπάρχει μια σειρά από εργαστηριακά πρωτόκολλα διαθέσιμα για ολική απομόνωση RNA, χρησιμοποιώντας μια ποικιλία προϊόντων που παράγονται από επιστημονικούς προμηθευτές.

Μπορεί να υπάρχει μια σειρά από πλεονεκτήματα στη συλλογή όλου του κυτταρικού RNA από ένα δείγμα ιστού. Μπορεί να δώσει πιο καθαρές και εύχρηστες πληροφορίες. Η τεχνική μπορεί επίσης να επιτρέψει στους ερευνητές να ελέγξουν για υποβάθμιση που μπορεί να προκαλέσει προβλήματα με τα πειράματα. Εάν το δείγμα είναι κακής ποιότητας, ο ερευνητής μπορεί να εξαγάγει ξανά RNA για να αποκτήσει μια καθαρότερη και πιο χρήσιμη συλλογή RNA. Αυτό μπορεί να είναι σημαντικό για πολλούς τύπους έρευνας, όπου το φτωχό RNA στην αρχή προκαλεί προβλήματα με τα πειράματα στη συνέχεια.

Οι τεχνικές για την απομόνωση ολικού RNA μπορεί να περιλαμβάνουν μια ποικιλία χημικών παραγόντων. Ορισμένοι επικεντρώνονται στη χρήση μη τοξικών χημικών ουσιών για τη μείωση του κινδύνου βλάβης στο δείγμα. Τέτοιες χημικές ουσίες περιορίζουν επίσης την κατάντη ρύπανση του RNA και είναι ασφαλέστερες για τους εργαζόμενους στο εργαστήριο. Τα εργαστήρια τείνουν να επιλέγουν μια συγκεκριμένη χημική ουσία και ένα πρωτόκολλο για να προτείνουν σε όλο το προσωπικό και να περιλαμβάνουν μια λεπτομερή περιγραφή της διαδικασίας απομόνωσης ολικού RNA στα εγχειρίδια τους. Αυτό εξασφαλίζει συνέπεια στην επεξεργασία του RNA στην εγκατάσταση για να αποφέρει πιο σταθερά και χρήσιμα αποτελέσματα.

Η διαδικασία ξεκινά με την προετοιμασία ενός δείγματος ιστού, το οποίο μπορεί να ποικίλλει σε μέγεθος, ώστε να είναι έτοιμο για επεξεργασία με τα οποία χημικά αντιδραστήρια θα αντλήσει το συνολικό RNA. Οι τεχνικοί συμβουλεύονται το εγχειρίδιο του εργαστηρίου για να καθορίσουν πώς να χειριστούν το δείγμα και να το επεξεργαστούν για να απομονώσουν το RNA. Μπορούν να χρησιμοποιήσουν εργαλεία όπως πλάκες ηλεκτροφόρησης για να ελέγξουν την ποιότητα του δείγματος, αναζητώντας σημάδια υποβάθμισης που μπορεί να υποδεικνύουν πρόβλημα με τη διαδικασία απομόνωσης ολικού RNA.

Οι ερευνητές μπορούν να πραγματοποιήσουν τη δική τους απομόνωση ολικού RNA ή να αναθέσουν αυτήν την εργασία σε βοηθό εργαστηρίου, μεταπτυχιακό φοιτητή ή παρόμοιο εργαστηριακό. Είναι επίσης δυνατό να γίνει σύμβαση απομόνωσης σε άλλες εργαστηριακές εγκαταστάσεις. Αυτό μπορεί μερικές φορές να είναι απαραίτητο για την προστασία της ακεραιότητας ενός πειράματος, χρησιμοποιώντας ένα τρίτο μέρος για τη δημιουργία επαληθεύσιμων και επαναλαμβανόμενων αποτελεσμάτων. Σε κάθε επιστημονική εργασία που βασίζεται σε έρευνα με το απομονωμένο RNA, ο ερευνητής πρέπει να συζητήσει τη μέθοδο που χρησιμοποιήθηκε για την απομόνωση και ποιος εκτέλεσε την εργασία.