Τι είναι το Kilobase;

Μια κιλοβάση είναι μια μέτρηση αρίθμησης που χρησιμοποιείται στον τομέα της γενετικής. Καθώς η βάση είναι ένα δομικό στοιχείο γενετικής πληροφορίας και κάθε οργανισμός περιέχει πολλές βάσεις, οι 1,000 βάσεις είναι ένας κοινός αριθμός που χρησιμοποιείται όταν συζητάμε πόσες βάσεις περιέχει η γενετική βιβλιοθήκη ενός οργανισμού. Αυτό το κομμάτι των 1,000 βάσεων αναφέρεται πιο σωστά ως κιλοβάση.
Κάθε ζωντανός οργανισμός περιέχει γενετικές πληροφορίες. Αυτές οι πληροφορίες εξηγούν στον οργανισμό ακριβώς ποια πρωτεϊνικά προϊόντα χρειάζεται ο οργανισμός για να ζήσει, να αναπτυχθεί και να πολλαπλασιαστεί. Όλες οι γενετικές πληροφορίες μαζί καλούνται γονιδίωμα του οργανισμού.

Κάθε γονιδίωμα χωρίζεται σε διακριτές τομές. Αυτά τα τμήματα, που ονομάζονται γονίδια, κωδικοποιούν ένα συγκεκριμένο προϊόν. Κάθε γονίδιο περιέχει μια σειρά από δομικά στοιχεία, που ονομάζονται βάσεις. Όταν ο οργανισμός διαβάζει τα γονίδια για να παράγει ένα συγκεκριμένο προϊόν, είναι η αλληλουχία των βάσεων μέσα στο γονίδιο που διαβάζει.

Μόνο τέσσερις βάσεις υπάρχουν στο DNA του γενετικού υλικού. Αυτές είναι η κυτοσίνη (C), η γουανίνη (G), η θυμίνη (Τ) και η αδενίνη (Α). Είναι η σειρά με την οποία είναι διατεταγμένες οι βάσεις σε ένα γονίδιο που υπαγορεύει τι κωδικοποιεί αυτό το γονίδιο. Η πολυπλοκότητα που απαιτείται για την παραγωγή όλων των προϊόντων που είναι απαραίτητα για την ανθρώπινη ζωή προκύπτει από το μήκος των γονιδίων και τον αριθμό των βάσεων μέσα σε αυτά.

Κάθε γονίδιο περιέχει έναν αξιοσημείωτο αριθμό βάσεων. Ολόκληρο το ανθρώπινο γονιδίωμα, για παράδειγμα, περιέχει 3 δισεκατομμύρια βάσεις, καθεμία σε συνδυασμό με μια άλλη βάση σε μια δομή σπειροειδούς έλικας. Η τεράστια ποσότητα βάσεων που υπάρχουν σε ένα γονιδίωμα σημαίνει ότι οι γενετιστές βρίσκουν ευκολότερο να αναφέρουν τα γονίδια ως x kilobases σε μήκος, σε αντίθεση με το μήκος 1,000 φορές x.

Ακόμη και το μικρότερο γονιδίωμα, όπως το γονιδίωμα του βακτηρίου Carsonella ruddii, περιέχει περίπου 160,000 ζεύγη βάσεων. Αυτό το μικροσκοπικό γονιδίωμα έχει μήκος περίπου 160 κιλοβάσεις (kb). Το ανθρώπινο γονιδίωμα, από την άλλη πλευρά, έχει μήκος 3 εκατομμύρια ζεύγη kilobase.
Η αλληλουχία των γονιδιωμάτων απαιτεί πρώτα να διασπαστεί το γονιδίωμα. Ο εξοπλισμός που εκτελεί την αλληλουχία μπορεί να χειριστεί μόνο τόσες πολλές βάσεις ταυτόχρονα. Οι γενετιστές μπορούν να χωρίσουν ένα γονιδίωμα σε πολλές ενότητες και να αναφέρουν ότι περιέχουν τόσα ζεύγη κιλοβάσεων, όπως ένα μήκος 150 ζευγών κιλοβάσεων. Αυτό το μέγεθος γενετικού υλικού μπορεί να τροποποιηθεί γενετικά σε έναν άλλο οργανισμό προκειμένου να πολλαπλασιαστεί το DNA σε ένα επίπεδο που είναι εύκολα αναγνώσιμο. Ακόμη και αυτά τα σχετικά μικρά κομμάτια DNA είναι πολύ μακριά για την άμεση αλληλούχιση, έτσι οι γενετιστές μπορούν στη συνέχεια να διασπάσουν ένα τμήμα 150 kb σε πολύ μικρότερα τμήματα μήκους μερικών εκατοντάδων βάσεων.