Υπεροργανισμός είναι κάθε άθροισμα μεμονωμένων οργανισμών που συμπεριφέρεται σαν ένας ενοποιημένος οργανισμός. Τα μέλη ενός υπεροργανισμού έχουν εξαιρετικά εξειδικευμένα κοινωνικά συνεργατικά ένστικτα, καταμερισμούς εργασίας και δεν είναι σε θέση να επιβιώσουν μακριά από τον υπεροργανισμό τους για πολύ μεγάλο χρονικό διάστημα. Το τυπικό παράδειγμα ενός υπεροργανισμού είναι μια αποικία μυρμηγκιών, αλλά υπάρχουν πολλά άλλα – σωροί τερμιτών, κυψέλες μελισσών, σφηκοφωλιές, κοραλλιογενείς ύφαλοι, αποικίες μυκήτων, ελαιώνες γενετικά πανομοιότυπων δέντρων κ.λπ.
Μερικοί έχουν προτείνει ότι οι άνθρωποι είναι ο καθένας ένας υπεροργανισμός, επειδή σε κάθε τυπικό ανθρώπινο ον υπάρχουν περισσότεροι από 1013 έως 1014 μικροοργανισμοί που εκτελούν ποικίλες εργασίες, αλλά κυρίως βοηθούν στην πέψη. Οι μικροοργανισμοί στο ανθρώπινο σώμα ξεπερνούν αριθμητικά τα κύτταρά μας πάνω από 10-προς-1 και το γενετικό τους υλικό ξεπερνάει το δικό μας 100-προς-1. Πολλά από αυτά δεν έχουν απομονωθεί ή μελετηθεί. Το έργο ανθρώπινου μικροβιώματος, ένα έργο 115 εκατομμυρίων δολαρίων ΗΠΑ από τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας, στοχεύει στον εντοπισμό και τον χαρακτηρισμό όσο το δυνατόν περισσότερων από αυτούς τους μικροοργανισμούς, που περιλαμβάνουν βακτήρια, αρχαία και ιούς.
Στον εμβληματικό υπεροργανισμό, μια αποικία μυρμηγκιών, υπάρχουν εξειδικευμένα μυρμήγκια για να αντιμετωπίσουν διάφορες εργασίες. Μυρμήγκια στρατιώτες για να υπερασπιστούν την αποικία, μυρμήγκια εργάτριες για να μαζέψουν τροφή, ένα μυρμήγκι βασίλισσα για να γεννήσει αυγά κ.λπ. Παρόμοιοι είναι και οι λόφοι τερμιτών. Οι τερμίτες κατασκευάζουν στην πραγματικότητα περίτεχνους τύμβους καθεδρικών ναών, οι οποίοι μπορεί να φτάσουν τα 9 μέτρα (30 πόδια) ύψος σε εξαιρετικές περιπτώσεις. Όλες αυτές οι αποικίες λειτουργούν ως ενοποιημένες οντότητες. Τα μυρμήγκια στρατιώτες μπορεί να θυσιαστούν πρόθυμα για την υπεράσπιση της φωλιάς, μια ασυνήθιστη συμπεριφορά μεταξύ των ζώων, τα οποία συνήθως διαμορφώνονται από την εξέλιξη ως αυτοσυντηρητικά.
Οι κοραλλιογενείς ύφαλοι θεωρούνται μερικές φορές υπεροργανισμοί λόγω του τρόπου με τον οποίο σχηματίζουν μια συνεχή μάζα ζώων. Όπως και άλλοι υπεροργανισμοί, οι οργανισμοί που αποτελούν έναν ύφαλο έχουν πολύ παρόμοιες, αν όχι πανομοιότυπες γενετικές δομές. Παρόλο που τα κοραλλιογενή ζώα σε έναν ύφαλο δεν συνεργάζονται ενεργά, η παρουσία τους ως βιότοπος για μια ευρεία ποικιλία ζώων φέρνει τόσο μεγάλη τροφή που αυτά τα ζώα συνεργάζονται, αν δεν το θέλουν. Ύφαλοι υπάρχουν, μείον μερικά κενά, από την αρχή της εποχής της Κάμβριας, περίπου 542 εκατομμύρια χρόνια πριν.
Μερικοί στοχαστές έχουν κάπως φανταστικά αποκαλέσει τα ανθρώπινα δίκτυα πληροφοριών ως τα αναδυόμενα σημάδια ενός παγκόσμιου υπεροργανισμού, αλλά αυτό δεν είναι πολύ σωστό καθώς οι άνθρωποι δεν έχουν εξελιχθεί για να συνεργάζονται σε τόσο μεγάλους αριθμούς. Για το μεγαλύτερο μέρος της ιστορίας μας, οι άνθρωποι έχουν συνεργαστεί σε ιεραρχικές φυλές 100-200 ατόμων, όπου κάθε άτομο έχει υψηλά συμφέροντα, η γονιδιακή δεξαμενή είναι ποικίλη και η συνεργασία κάθε άλλο παρά τέλεια είναι. Οι παγκόσμιοι πληθυσμοί που ξεπερνούν τα 5 εκατομμύρια είναι ένα σχετικά πρόσφατο φαινόμενο και οι άνθρωποι δεν είχαν χρόνο να εξελιχθούν για να αποκτήσουν χαρακτηριστικά υπογραφής των συστατικών μελών ενός υπεροργανισμού. Επιπλέον, δεν υπάρχει ενεργή πίεση επιλογής προς αυτή την κατεύθυνση.