Multe instrumente special concepute pentru repararea bicicletei au fost dezvoltate pentru a întreține anumite părți ale bicicletei. În timp ce multe reparații pot fi făcute cu un set de chei hexagonale și șurubelnițe, alte reparații necesită instrumente special concepute și nu pot fi făcute cu succes fără ele. Cele mai comune instrumente de reparare a bicicletelor sunt manetele pentru anvelope, care ajută un ciclist să scoată anvelopa de pe jantă pentru a schimba o cameră perforată sau a înlocui anvelopa. Aceste pârghii sunt fabricate din plastic în majoritatea cazurilor pentru a evita deteriorarea jantei, deși sunt disponibile și pârghii metalice. Totuși, acestea pot deteriora janta și nu sunt recomandate pentru majoritatea aplicațiilor pentru biciclete.
Alte instrumente de reparare a bicicletelor includ chei pentru spițe, suporturi de curățare și drivere pentru niplu. Aceste instrumente sunt folosite pentru a construi și întreține roțile de bicicletă. Un suport de reglare permite unei persoane să măsoare cât de dreaptă și rotundă este roata la un moment dat, iar cheile pentru spițe îi permit persoanei să strângă sau să slăbească spițele dacă roata necesită ajustare. Un driver de mamelon este un instrument special conceput care ajută o persoană să instaleze rapid și ușor nipluri noi de spițe. Construirea roților este o sarcină complexă care necesită abilități și practică semnificative și nu poate fi făcută bine sau deloc fără aceste instrumente de reparare a bicicletelor.
Cheile cu con sunt chei foarte subțiri utilizate pentru reglarea butucurilor roților bicicletei. Cheile sunt plate pentru a permite unei persoane să lucreze cheia în locuri foarte strânse; piulițele și conurile roților — care se apasă pe rulmenții din interiorul butucului — sunt contrastrânse una față de cealaltă, astfel încât poate fi dificil să prindeți bine aceste piulițe subțiri. Cheile cu con fac acest proces mult mai ușor.
O presă pentru căști pentru căști este un dispozitiv folosit pentru a presa cupele de rulment nefiletate în tubul de direcție al bicicletei. Tubul de direcție este partea din cadrul prin care furca bicicletei este culisată și atașată de tijă, care este la rândul ei atașată de ghidon. Presa este filetată și pune presiune pe cupe, pe măsură ce utilizatorul înfilează mânerul în jos din ce în ce mai mult.
Alte instrumente de reparare a bicicletelor includ un indicator de aliniere al suportului schimbătorului, unelte pentru inele de blocare a casetei, extractoare de pedalier, extractoare de manivelă și diverse alte instrumente special concepute. Un indicator de aliniere a umerașului permite unei persoane să îndrepte partea din cadrul de care este atașat schimbătorul spate, în cazul în care acesta se îndoaie. Instrumentele cu inel de blocare a casetei permit utilizatorului să scoată grupul de viteze din spate. Extractoarele de pedalier permit utilizatorului să îndepărteze sau să instaleze un pedalier, care este un set de rulmenți în partea de jos a cadrului. Pentru a utiliza acest instrument, manivelele bicicletei trebuie îndepărtate folosind un extractor de manivelă.