Cuantificarea acidului ribonucleic (ARN) este un mijloc de determinare a concentrației medii de ARN într-o soluție. Această determinare poate fi efectuată folosind o varietate de proceduri, care de obicei se încadrează în una din două categorii: spectrofotometrie sau cuantificarea coloranților fluorescenți. Spectrofotometria se bazează pe capacitatea ARN-ului de a absorbi anumite lungimi de undă de lumină ultravioletă. Unii coloranți fluorescenți, cum ar fi bromura de etidio, se pot lega de acizi nucleici precum ARN-ul și vor avea fluorescență atunci când se leagă, permițând măsurarea luminozității.
Când ARN-ul este expus la lumina ultravioletă, va absorbi selectiv această lumină la lungimi de undă de 260 nanometri (nm) și 280 nm. Această metodă este efectuată într-un spectrofotometru, care produce lungimi de undă de lumină ultravioletă și măsoară lumina care trece prin ARN. Concentrații mai mari de ARN vor absorbi mai multă lumină.
O combinație a acestor două lungimi de undă este adesea folosită în cuantificarea ARN, deoarece această metodă permite cercetătorilor să afle dacă o probă este contaminată de alte macromolecule, cum ar fi proteinele. Acești contaminanți vor absorbi adesea selectiv lumina de 280 nm, dar nu și lumina la 260 nm. Ca rezultat, calcularea raportului de lumină absorbită la ambele lungimi de undă poate determina gradul de contaminare.
Cuantificarea ARN folosind coloranți fluorescenți dă rezultate care sunt mai puțin sensibile la unii contaminanți și pot fi utilizate cu niveluri scăzute de ARN care ar face imposibilă spectrofotometria. Coloranții precum bromura de etidio se vor lega de ARN, iar luminozitatea rezultată poate fi măsurată direct folosind fotometre cu fluorescență. Dacă nu este disponibil un fotometru, pot fi preparate soluții cu concentrații cunoscute de ARN, iar luminozitatea probei necunoscute poate fi comparată aproximativ cu acestea. Relația dintre luminozitate și concentrația de ARN este liniară, astfel încât cercetătorii pot determina rapid o măsurare a concentrației din luminozitate.
Cuantificarea ARN folosind oricare dintre metode poate fi foarte susceptibilă la diferiți contaminanți. Proteinele, fenolul și particulele mari pot face ca rezultatele spectrofotometriei să fie inexacte. Acești contaminanți nu afectează cuantificarea ARN colorantului fluorescent, dar această metodă poate fi inexactă prin prezența acidului dezoxiribonucleic (ADN) într-o probă.
Coloranții care leagă acizii nucleici vor lega atât ADN-ul, cât și ARN-ul și vor prezenta luminozități similare, așa că este important să se asigure o probă curată de ARN. Modul obișnuit de a realiza acest lucru este prin adăugarea unei enzime care distruge ADN-ul, cum ar fi ADNază, la o probă mixtă înainte de a adăuga un colorant. În funcție de concentrația de ARN dintr-o probă și de contaminanții prezenți, laboratoarele pot utiliza oricare dintre aceste metode pentru a cuantifica ARN.