Ce este SYBR Green®?

SYBR Green® este un colorant fluorescent care se leagă de ADN-ul dublu catenar cu o mare specificitate. Este utilizat pe scară largă în cercetarea în biologie moleculară pentru a cuantifica și vizualiza ADN-ul dublu catenar. SYBR Green® este un colorant sintetic, care a fost introdus la începutul anilor 1990 de Molecular Probes®, Inc., o subsidiară a Invitrogen&trade Corporation. Este un colorant cu cianuri asimetrice, cianinele fiind o familie de coloranți organici sintetici care sunt utilizați în fotografie, suporturi CD-R și DVD-R și într-o varietate de aplicații de cercetare în biologie moleculară.

Mai multe caracteristici fac ca SYBR Green® să fie deosebit de util ca colorant de acid nucleic. Este stabil pe o gamă de temperaturi, ceea ce înseamnă că poate fi folosit pentru a monitoriza reacțiile biochimice care au loc la temperaturi ridicate și scăzute. Se leagă necovalent de suprafața ADN-ului, ceea ce înseamnă că nu va interfera cu activitatea majorității nucleazelor și ADN polimerazelor. De asemenea, se leagă de acizii nucleici într-un interval liniar dinamic de până la patru ordine de mărime, astfel încât poate oferi o cuantificare precisă a ADN-ului într-o gamă largă de concentrații.

Cele mai frecvente utilizări de laborator ale SYBR Green® sunt detectarea ADN-ului dublu catenar în reacția în lanț a polimerazei (PCR) în timp real și în geluri de acrilamidă. PCR este o tehnică de amplificare a câtorva copii ale ADN-ului prin cicluri repetate de replicare a ADN-ului. PCR în timp real măsoară amplificarea pe măsură ce are loc și, deoarece SYBR Green® se leagă de ADN-ul dublu catenar, măsurarea emisiei de fluorescență a complexului ADN-colorant permite cercetătorului să cuantifice cantitatea de ADN produsă. Pe măsură ce ciclurile PCR progresează, există o creștere a fluorescenței proporțională cu cantitatea de produs PCR produs.

Gelurile de acrilamidă sunt omniprezente în laboratoarele de biologie moleculară, deoarece servesc scopului necesar în mod obișnuit de a separa fragmentele de ADN după dimensiune. SYBR Green® permite cercetătorului să vizualizeze ADN-ul într-un gel de acrilamidă prin strălucirea luminii cu lungimea de undă adecvată pe acesta. Alte utilizări ale SYBR Green® includ detectarea acizilor nucleici în soluție, în aplicații cu biocipuri și în citometria în flux. Complexul ADN-colorant absoarbe lumina albastră la 488 nm și emite lumină verde la 522 nm.

SYBR Green® este foarte sensibil; este de 25 de ori mai sensibil decât bromura de etidio, un alt colorant folosit în mod obișnuit pentru vizualizarea ADN-ului. Afinitatea ridicată a SYBR Green® pentru ADN-ul dublu catenar îl face util pentru detectarea probelor de ADN cu număr mic de copii. Se leagă de preferință ADN-ul dublu catenar, dar poate lega și ADN-ul monocatenar cu fluorescență redusă. Ca și în cazul oricărei molecule de legare a ADN-ului, SYBR Green® poate provoca mutații și este un posibil cancerigen. Cu toate acestea, este mai sigur să lucrați și mai ușor de eliminat decât bromura de etidio.