Υπάρχει μια δοκιμαστική σύνδεση μεταξύ της σερτραλίνης και της τριχόπτωσης, αλλά είναι μόνο μια σπάνια και πιθανώς προσωρινή παρενέργεια της θεραπείας. Παρά τη χαμηλή πιθανότητα το φάρμακο να προκαλέσει τριχόπτωση, θεωρείται ευρέως ως πιθανή παρενέργεια. Η πιθανότητα ένας ασθενής που παίρνει το φάρμακο να παρουσιάσει απώλεια μαλλιών είναι μεταξύ 1 στα 100 και 1 στα 1,000. Κάθε ασθενής που αντιμετωπίζει την παρενέργεια θα πρέπει να το συζητήσει με έναν επαγγελματία ιατρό, ο οποίος μπορεί να είναι σε θέση να προτείνει μια εναλλακτική θεραπεία για την αρχική πάθηση, επιτρέποντας στα μαλλιά να αναπτυχθούν ξανά.
Πολλά αντικαταθλιπτικά φάρμακα, συμπεριλαμβανομένης της σερτραλίνης και της φλουοξετίνης, είναι γνωστό ότι προκαλούν απώλεια μαλλιών σε ορισμένους ασθενείς. Θεωρείται όμως ότι είναι μια σπάνια παρενέργεια. Το σχετικά υψηλό ποσοστό τριχόπτωσης μεταξύ του γενικού πληθυσμού μπορεί να δυσκολέψει τον προσδιορισμό του αν όντως είναι το φάρμακο που προκαλεί το πρόβλημα. Η αλληλεπίδραση εμφανίζεται σε λιγότερο από το 1% των ασθενών που λαμβάνουν το φάρμακο, επομένως εάν ένας ασθενής έχει τριχόπτωση στην οικογένειά του, αυτό είναι πιο πιθανό να είναι η αιτία.
Η σερτραλίνη ταξινομείται ως εκλεκτικός αναστολέας επαναπρόσληψης σεροτονίνης (SSRI), ο οποίος χρησιμοποιείται για τη θεραπεία της κατάθλιψης. Πολλοί ιατροί πιστεύουν ότι η ανισορροπία των νευροδιαβιβαστών στον εγκέφαλο είναι η αιτία της κατάθλιψης. Ο κύριος νευροδιαβιβαστής που πιστεύεται ότι έχει ιδιαίτερη σημασία είναι η σεροτονίνη και η σερτραλίνη δρα εμποδίζοντας το νεύρο που παρήγαγε τη χημική ουσία να την επαναφέρει. Ένας άλλος νευροδιαβιβαστής, η ντοπαμίνη, εμποδίζεται επίσης να προσληφθεί από το ίδιο νεύρο από αυτό το φάρμακο. Μερικοί ιατροί πιστεύουν ότι αυτό θα μπορούσε να είναι μια πιθανή αιτία για τη σχέση μεταξύ σερτραλίνης και τριχόπτωσης.
Μελέτες έχουν δείξει ότι ορισμένοι ασθενείς που αρχικά έπαιρναν άλλα αντικαταθλιπτικά φάρμακα, όπως η φλουοξετίνη, δεν παρουσίασαν απώλεια μαλλιών έως ότου αλλάξουν με σερτραλίνη. Η βασική διαφορά μεταξύ των δύο είναι η επίδραση που έχει το φάρμακο στα επίπεδα ντοπαμίνης. Αυτή η έρευνα έδειξε ότι η σερτραλίνη θα μπορούσε να συνδέεται στενότερα με την τριχόπτωση από άλλα παρόμοια φάρμακα. Οι ασθενείς παρουσίασαν απώλεια μαλλιών κατά τη λήψη αυτού του φαρμάκου, αλλά δεν έχουν καθόλου κατά τη διάρκεια της θεραπείας με φλουοξετίνη πριν και μετά τη λήψη σερτραλίνης. Αυτή η επίδραση μπορεί να εμφανιστεί τόσο σε άνδρες όσο και σε γυναίκες ασθενείς.
Σε γενικές γραμμές — εάν ο ασθενής δεν έχει οικογενειακό ιστορικό τριχόπτωσης — η απώλεια θα σταματήσει εάν ο ασθενής σταματήσει να παίρνει σερτραλίνη. Κατά κάποιο τρόπο, αυτό κάνει τη σύνδεση πιο έντονη, επειδή συμβαίνει ειδικά όταν ο ασθενής παίρνει το φάρμακο. Οι ασθενείς που έχουν πρόβλημα με τη σερτραλίνη και την τριχόπτωση θα πρέπει να συμβουλευτούν έναν γιατρό, ο οποίος μπορεί να είναι σε θέση να προτείνει μια εναλλακτική θεραπεία που δεν προκαλεί αυτή την παρενέργεια. Εάν υπάρχει οικογενειακό ιστορικό τριχόπτωσης, ωστόσο, η κατάσταση μπορεί να μην διορθωθεί ποτέ από μόνη της, ακόμη και όταν ο ασθενής σταματήσει να παίρνει το φάρμακο.