Η αντίσταση στα αντιικά εμφανίζεται όταν ένας ιός δεν μπορεί πλέον να καταστραφεί από το φάρμακο που χρησιμοποιείται εναντίον του. Αυτή η αντίσταση είναι ένας φυσικός μηχανισμός επιβίωσης του ιού, μια αναγκαστική εξέλιξη που προκαλείται από αυθόρμητη μετάλλαξη που στη συνέχεια μεταβιβάζεται στις επόμενες γενιές. Η αντίσταση στα αντιικά είναι ένα διαρκές πρόβλημα στην ιατρική και οι γιατροί πρέπει να είναι συνετοί και δημιουργικοί όταν συμβαδίζουν με τα εξελισσόμενα στελέχη.
Η αντίσταση στα αντιιικά φάρμακα εμφανίζεται αρχικά μέσω αυθόρμητης μετάλλαξης που επιτρέπει σε έναν αριθμό ιών να επιβιώσουν από τις επιπτώσεις των φαρμάκων. Αυτή η μετάλλαξη μεταβιβάζεται στη συνέχεια στις επόμενες γενιές. Υπάρχουν διάφοροι τρόποι με τους οποίους η μετάλλαξη καθιστά τον ιό ανοσοποιητικό. Η μετάλλαξη μπορεί να έχει ως αποτέλεσμα ο ιός να δημιουργεί μια μορφή αναστολέα που είτε τροποποιεί είτε αδρανοποιεί το ίδιο το φάρμακο. Ένας ιός μπορεί να αλλάξει τη διαμόρφωση της θέσης στην οποία το φάρμακο θα δεσμευόταν κανονικά σε αυτόν για καταστροφή, με αποτέλεσμα το φάρμακο να μην μπορεί να συνδεθεί και να του επιτεθεί.
Η μεταβολική οδός του ιού μπορεί να αλλοιωθεί, επιτρέποντάς του να βρει εναλλακτικούς τρόπους μόλυνσης του ξενιστή, έτσι ώστε το ειδικά σχεδιασμένο φάρμακο να καταστεί αναποτελεσματικό. Τέλος, ο ιός μπορεί να μειώσει τη διαπερατότητα του, μειώνοντας την ικανότητα του φαρμάκου να συσσωρεύεται σε αρκετά μεγάλες ποσότητες για να τον ξεπεράσει. Καθώς αυτά τα χαρακτηριστικά μεταβιβάζονται μέσω γενεών του ιού, το αποτέλεσμα είναι ένα στέλεχος ανθεκτικό στα φάρμακα. Τα στελέχη του ιού μπορεί να γίνουν ανθεκτικά σε μεμονωμένα ή πολλαπλά φάρμακα, με αποτέλεσμα να δημιουργούνται υπερβακτηρίδια.
Η αντίσταση στα αντιικά είναι ένα σημαντικό πρόβλημα επειδή καθιστά πολύ πιο δύσκολο για τους γιατρούς να καταπολεμήσουν αποτελεσματικά τους ιούς. Οι ιοί που κάποτε ήταν θεραπεύσιμοι γίνονται ξαφνικά μη θεραπεύσιμοι και η ιατρική κοινότητα έχει έναν δύσκολο αγώνα να προσπαθήσει να συμβαδίσει. Σε καταστάσεις όπως ο HIV, η φυματίωση και η γρίπη, πρέπει συνεχώς να ερευνώνται και να δημιουργούνται νέα μεμονωμένα και συνδυαστικά φάρμακα προκειμένου να διατηρηθεί η νόσος υπό έλεγχο. Ακόμη και ιοί όπως ο σταφυλόκοκκος, που αντιμετωπίστηκε εύκολα, έχουν αναπτύξει ανθεκτικά στελέχη. Υπάρχουν σημαντικές επιπτώσεις τόσο για ανοσοκατασταλμένους ασθενείς όσο και για πιθανές πανδημίες με αντίσταση στα αντιικά.
Τα ανθεκτικά στελέχη του ιού προκαλούνται σε μεγάλο βαθμό από την υπερβολική συνταγογράφηση αντιβιοτικών και αντιμικροβιακών για ασθένειες που ο ασθενής θα μπορούσε να καταπολεμήσει φυσικά. Αυτά τα φάρμακα λαμβάνονται επίσης συχνά ανεύθυνα, με τους ασθενείς να σταματούν τα φάρμακα πριν ολοκληρώσουν την πλήρη συνταγογραφούμενη πορεία. Αυτό στη συνέχεια έχει ως αποτέλεσμα ορισμένοι ιοί να επιβιώνουν και να γίνονται ανθεκτικοί. Η υπερβολική χρήση οικιακών προϊόντων καθαρισμού ενοχοποιείται επίσης καθώς οι κοινοί ιοί εκτίθενται συνεχώς στα προϊόντα αλλά δεν σκοτώνονται πάντα, επιτρέποντας στα στελέχη να δημιουργήσουν αντίσταση.
Η αντίσταση στα αντιικά καταπολεμάται με τη συνετή και φειδωλή συνταγογράφηση φαρμάκων από τους γιατρούς και την ισχυρή σύσταση ότι οι ασθενείς λαμβάνουν την πλήρη πορεία των φαρμάκων που τους συνταγογραφούν. Πολλά φάρμακα χρησιμοποιούνται επίσης ταυτόχρονα για τη θεραπεία λοιμώξεων όπως ο HIV, με την ελπίδα ότι ο ιός δεν θα γίνει ανθεκτικός σε όλους, αν και αυτό συμβαίνει. Τέλος, χρησιμοποιείται φαγοθεραπεία όπου οι βακτηριοφάγοι απελευθερώνονται στον ασθενή για να καταναλώσουν και να καταστρέψουν τον ιό.