Υπάρχει πολλή ιστορία, αποχρώσεις και πολυπλοκότητα στο θέμα, αλλά ένας από τους κύριους λόγους που δημιουργήθηκε το Πακιστάν ήταν λόγω της θρησκείας. Η εκτεταμένη χερσαία μάζα που ήταν η αποικιακή Ινδία υπό βρετανική κυριαρχία χωρίστηκε σε τρία διακριτά μέρη. Κάθε ένα από αυτά δημιουργήθηκε επειδή η πλειονότητα των κατοίκων του λάτρευε μία από τις δύο θρησκείες, τον Ινδουισμό και το Ισλάμ. Αυτό συνέβη το 1947.
Το κίνημα ανεξαρτησίας στην Ινδία ξεκίνησε σοβαρά το τελευταίο μισό του 19ου αιώνα. Στη συνέχεια απέκτησε δύναμη στις αρχές του 20ου αιώνα, καθώς ο εθνικισμός σάρωσε την Ασία και την Αφρική όπως και την Ευρώπη έναν αιώνα πριν. Σταυροφόροι όπως ο Μοχάντας Γκάντι άρχισαν να εκστρατεύουν για την ανεξαρτησία από τη Βρετανία. Η εκστρατεία ανεξαρτησίας κέρδισε διεθνή εστίαση, χάρη σε μεγάλο βαθμό στις ενέργειες του Γκάντι και μερικών άλλων γενναίων ανθρώπων, και η πίεση ήταν τελικά υπερβολική για να αγνοήσει η Βρετανία.
Η Ινδία, ωστόσο, δεν ήταν απλώς μια χώρα γεμάτη ομοϊδεάτες όσον αφορά τη λατρεία. Δύο θεμελιωδώς διαφορετικές θρησκείες κυριαρχούσαν στο γεμάτο ψυχή τοπίο της δεύτερης πολυπληθέστερης χώρας του κόσμου. Η σύγκρουση μεταξύ των οπαδών αυτών των δύο θρησκειών ξεπέρασε τη διχοτόμηση από την αποικιακή Ινδία στην Ινδία και το Πακιστάν. Ο Ινδουισμός, μια από τις παλαιότερες θρησκείες του κόσμου, είχε εκατομμύρια οπαδούς που ζούσαν στην Ινδία. Το Ισλάμ έκανε επίσης, αν και η ιστορία του ήταν πολύ μικρότερη.
Οι Βρετανοί χώρισαν την αποικιακή Ινδία ανάλογα με τις ανησυχίες του πληθυσμού. Η Ινδία ήταν τότε και συνεχίζει να κατοικείται κυρίως από Ινδουιστές. Το Πακιστάν, από την άλλη, είχε και συνεχίζει να έχει κυρίως μουσουλμανικό πληθυσμό. Ωστόσο, κανένα από αυτά δεν είναι ομοιογενές και η διαίρεση χώρισε πολλούς ανθρώπους από τις οικογένειές τους.
Όπως και η οικοδόμηση του Τείχους του Βερολίνου, η διχοτόμηση της Ινδίας δημιούργησε τόσα προβλήματα όσα έλυσε. Η Ινδία ήταν μια χώρα κυρίως ινδουιστική, ναι, αλλά είχε μια αρκετά μεγάλη μουσουλμανική μειονότητα. Το ίδιο ίσχυε, αντίστροφα, για το Πακιστάν, που ήταν στην πραγματικότητα δύο τοπία στην αρχή. Το 1947, το Πακιστάν ήταν στην πραγματικότητα Δυτικό και Ανατολικό Πακιστάν, με την Ινδία ακριβώς στη μέση. Η Ινδία χώρισε και τις δύο χώρες χωρίς να υπάρχει τρόπος σύνδεσης των δύο. Το Ανατολικό Πακιστάν έγινε Μπαγκλαντές το 1971.
Η ξαφνική διαίρεση της αποικίας σε δύο χωριστές χώρες οδήγησε σε μαζική έξοδο. Οι μουσουλμάνοι πήγαν στο Πακιστάν και οι Ινδουιστές στην Ινδία. Ορισμένες εκτιμήσεις ανεβάζουν την «ανταλλαγή πληθυσμού» σε περισσότερα από 14 εκατομμύρια. Οι εξόδους οδήγησαν σε μαζικό χάος και υστερία, που συχνά συνοδεύονταν από βία. Σε πολλές περιπτώσεις, σφαγές με βάση τη πίστη συνέβησαν πίσω από τις γραμμές της χώρας.
Ένα άλλο τεράστιο σημείο μερικές φορές βίαιης συζήτησης μεταξύ Ινδίας και Πακιστάν ήταν η περιοχή μεταξύ των δύο χωρών που διεκδικούν και οι δύο χώρες. Μέρος αυτής της περιοχής, γνωστής ως Κασμίρ, υπήρξε τόπος πολλών συγκρούσεων και είναι μια από τις πιο στρατιωτικοποιημένες περιοχές εδαφικών διαφορών, με περιοχές που ελέγχονται από το Πακιστάν, την Ινδία και την Κίνα. Οι συγκρούσεις για αυτήν την περιοχή και για άλλα σοβαρά ζητήματα οδήγησαν σε μια κλιμακούμενη κούρσα εξοπλισμών μεταξύ Ινδίας και Πακιστάν, με τις δύο πλευρές να ισχυρίζονται ότι διαθέτουν πυρηνικά όπλα.