Gatunek wskaźnikowy lub bioindykator to gatunek rośliny lub zwierzęcia, który służy do gromadzenia informacji o środowisku lub obszarze. Obecność takiego gatunku może być sygnałem, podobnie jak ich brak. Liczne gatunki roślin i zwierząt są wykorzystywane jako wskaźniki, wraz z organizmami, takimi jak porosty i grzyby, w środowiskach od szczytów górskich po szelf kontynentalny.
Obecność gatunku wskaźnikowego często definiuje konkretny ekoregion. Na przykład pewien rodzaj drzewa może rosnąć tylko na bardzo określonym obszarze lub określony ssak może wędrować tylko w określonym regionie. Jeśli gatunek zacznie zanikać, można by powiedzieć, że ekoregion się kurczy, co może budzić obawy o zdrowie środowiska na tym obszarze. Liczne organizacje śledzą obecność gatunków wskaźnikowych, zwłaszcza na obszarach wrażliwych, aby sprawdzić, czy siedliska kurczą się lub nie ulegają uszkodzeniu.
Gatunki te mogą być również wykorzystywane bardziej ogólnie do zbierania informacji o stanie zdrowia środowiska. Niektóre gatunki wskaźnikowe są wybierane specjalnie, ponieważ są niezwykle wrażliwe na zanieczyszczenia lub ingerencję człowieka, dzięki czemu badacze śledzący te gatunki mogą wcześnie zidentyfikować problemy. Inni mogą zachorować, co sugeruje obecność choroby, którą należy się zająć, lub mogą migrować lub rozwijać zachowania stresowe w odpowiedzi na zmianę klimatu. Wszystkie te zmiany w naturalnym porządku można obserwować i śledzić, aby mieć oko na środowisko.
Gatunki wskaźnikowe były wykorzystywane w przeszłości do zbierania informacji o składzie geologicznym wielu regionów. Niektóre rośliny rosną obficie np. w obecności określonych minerałów, więc obecność takich roślin może świadczyć o obfitości tych minerałów. Inne rośliny lubią mokry, bagnisty grunt, co sugeruje obecność źródła wody, gdy są obfite. Wiadomo również, że niektóre rośliny zmieniają kolor w odpowiedzi na obecność określonych minerałów i chemikaliów.
Naukowcy określają, które gatunki w regionie są gatunkami wskaźnikowymi na podstawie badań terenowych, danych historycznych i znanych informacji o tych gatunkach. Kiedy agencja rządowa korzysta z tego typu systemu, zwykle dokumentuje proces determinacji skrupulatnie, na wypadek gdyby decyzje podjęte na podstawie gatunku wskaźnikowego zostały zakwestionowane przez inne agencje lub obywateli.