Termin „naturalna woda kolońska” jest zwykle używany do opisania pachnącej wody kolońskiej, która jest wytwarzana z naturalnych substancji zapachowych, takich jak olejki eteryczne. Należy jednak zauważyć, że w wielu jurysdykcjach, w tym w Stanach Zjednoczonych, nie ma ograniczeń prawnych dotyczących używania słowa „naturalny” w żywności, kosmetykach czy produktach higieny osobistej. Oznacza to, że każdy producent produktów zapachowych może używać słowa „naturalny” w swoich etykietach. Podczas gdy niektórzy ludzie mogą czuć się bardziej komfortowo, kupując lub wytwarzając naturalne wody kolońskie z pachnących olejków lub całych ziół i przypraw, powinni być również świadomi, że nawet te składniki mogą powodować podrażnienia skóry i wywoływać alergie. Osoby, które kupują naturalną wodę kolońską, powinny zwracać uwagę na swoją skórę i samopoczucie po użyciu produktu, tak samo jak w przypadku każdego innego pachnącego kosmetyku lub produktu do higieny osobistej, i być gotowe do wyrzucenia wody kolońskiej, jeśli wydaje się, że przyczynia się ona do wysypki lub dyskomfortu w oddychaniu .
Wiele wód kolońskich, perfum i innych produktów zapachowych jest wytwarzanych z różnych syntetycznych zapachów lub z połączenia naturalnych i syntetycznych zapachów. Niektórzy ludzie są zainteresowani noszeniem zapachów, które pochodzą w całości i bezpośrednio z różnych roślin, orzechów i owoców. Mogą chcieć to zrobić, ponieważ obawiają się wpływu różnych syntetycznych chemikaliów na ich zdrowie lub środowisko. Inni mogą być zainteresowani noszeniem naturalnej wody kolońskiej w ramach schematu aromaterapii. W takich przypadkach osoby te mogą zdecydować się na wykonanie własnych zapachów w domu lub na zakup naturalnej wody kolońskiej od producenta lub aromaterapeuty.
Niektóre rodzaje naturalnych wód kolońskich mogą składać się głównie z jednego rodzaju zapachu, a inne mogą być mieszanką. Chociaż na rynku dostępnych jest kilka oryginalnych zapachów, nie jest niczym niezwykłym, że niektórzy perfumiarze lub aromaterapeuci opracowują zapach, który naśladuje popularną markę dostępnych na rynku perfum lub wody kolońskiej. Użytkownicy tych zapachów mogą czuć się z nimi bardziej komfortowo, ponieważ są wykonane z olejków eterycznych, a nie syntetycznych, a także mogą zaoszczędzić pieniądze, unikając kosztów produktów z wyższej półki.
Nabywcy naturalnych wód kolońskich lub zainteresowani kwestiami środowiskowymi powinni poświęcić trochę czasu na zapytanie o pochodzenie olejków i innych składników użytych do produkcji zapachu. Nie wszystkie olejki eteryczne są wytwarzane ze składników organicznych lub pochodzących ze sprawiedliwego handlu, więc osoby zainteresowane tymi zagadnieniami mogą chcieć dowiedzieć się więcej o historii składników używanych do produkcji określonej wody kolońskiej. Użytkownicy ci powinni również mieć świadomość, że niektóre olejki eteryczne, takie jak olejki cytrusowe, mogą wywoływać nadwrażliwość na światło, czyniąc niektóre osoby bardziej podatnymi na oparzenia słoneczne i chorobę posłoneczną. Ci, którzy spryskują całe ciało naturalną wodą kolońską zawierającą olejki, które zwiększają wrażliwość, mogą chcieć zachować szczególną ostrożność stosując wysokiej jakości filtr przeciwsłoneczny.