Strep gardła to stan chorobowy wywołany przez infekcję bakterią paciorkowca i powodujący ból gardła, gorączkę i obrzęk węzłów chłonnych. Amoksycylina jest antybiotykiem często stosowanym w leczeniu paciorkowca, ale jego przydatność w leczeniu infekcji paciorkowcami jest obecnie kwestionowana. Ostatnie przeglądy skuteczności amoksycyliny w leczeniu paciorkowca wykazały, że amoksycylina nie leczy infekcji u około dwóch na dziesięć osób leczonych z powodu paciorkowca. Kiedy amoksycylina zawodzi, wynikiem jest przedłużona infekcja i potrzeba drugiego cyklu innego antybiotyku.
Antybiotyki są prawie zawsze stosowane w leczeniu anginy, ponieważ angina jest infekcją wywoływaną wyłącznie przez bakterie, a nie wirusy, a jej obecność można łatwo wykryć szybkim testem. Ponadto leczenie antybiotykami w przypadku paciorkowca tradycyjnie skróciło czas trwania i nasilenie infekcji i często udaremniało wtórne powikłania, takie jak infekcje zatok i uszu. Stosowanie penicyliny i amoksycyliny w leczeniu paciorkowców było w przeszłości dobrym i skutecznym wyborem, ale obecnie oba antybiotyki stają się coraz bardziej niewystarczające. Przyczyną niepowodzenia amoksycyliny w leczeniu paciorkowca nie wydaje się być rozwój szczepu bakterii paciorkowca, który jest oporny na amoksycylinę.
Dwie możliwe teorie mogą wyjaśniać sporadyczną nieskuteczność amoksycyliny w leczeniu paciorkowca. Wcześniej uważano, że paciorkowce istnieją tylko poza komórkami, ale ostatnie badania wykazały, że jest to nieprawda. Obecnie wiadomo, że paciorkowce są czasami zdolne do penetracji i przetrwania wewnątrz komórek górnych dróg oddechowych. Ponieważ amoksycylina nie jest w stanie przeniknąć przez błonę komórkową, nie może wejść w kontakt z bakteriami, aby ją zniszczyć. W przypadkach, w których bakterie paciorkowca przeniknęły do komórek gardła, mogą wytrzymać leczenie amoksycyliną.
W drugim wyjaśnieniu bakterie paciorkowca współkolonizują się z innymi bakteriami, które są oporne na amoksycylinę i mogą pozwolić paciorkowca łatwiej przylegać do gardła. Te szczególne flory są zdolne do wydzielania substancji chemicznej zwanej beta-laktamazą, która może dezaktywować amoksycylinę. Dzięki współkolonizacji bakterie paciorkowca, chociaż same nie są lekooporne, mogą korzystać z mechanizmów oporności stosowanych przez sąsiednie bakterie. Nie każdy ma te specjalne bakterie, więc w niektórych przypadkach amoksycylina na paciorkowce jest nadal przydatna. Jeśli te specjalne bakterie są obecne w gardle, może to wyjaśniać niepowodzenie amoksycyliny w leczeniu paciorkowców.
Dzięki tym nowym informacjom zmieniają się wytyczne dotyczące leczenia paciorkowca. Cefaleksyna, cefalosporyna lub azytromycyna są obecnie często przepisywane na infekcję paciorkowcową. Amoksycylina jest nadal stosowana w leczeniu zapalenia płuc, infekcji zatok i infekcji ucha.