Najlepszy filtr HEPA (High Efficiency Particulate Air) do domowego pieca to taki, który usunie alergeny na poziomie niezbędnym do zapewnienia ludziom komfortu. Filtr piecowy HEPA musi być w stanie usunąć 99.97% wszystkich cząstek o wielkości 0.3 mikrona lub więcej, aby mógł być oznaczony jako taki. Wydajność filtra pieca jest oceniana w skali raportowania minimalnej wydajności (MERV). Filtry z niskimi numerami odfiltrowują tylko największe zanieczyszczenia i kurz, aby chronić system pieca. Filtry o dużej liczbie, w tym filtry HEPA, usuwają mniejsze cząsteczki i więcej alergenów, aby poprawić jakość powietrza.
Niektóre osoby z poważnymi alergiami i problemami z oddychaniem potrzebują najpotężniejszych dostępnych filtrów, podczas gdy inne są zadowolone z filtrów o niskim wskaźniku MERV. Ci, którzy potrzebują lepszej filtracji, powinni szukać filtrów o wartości od 12 do 16 w skali MERV. Jest jednak ważne rozróżnienie, o którym należy pamiętać przy zakupie filtrów. Standardowy filtr piecowy o grubości 1 cala (2.54 cm) zazwyczaj nie jest prawdziwym filtrem piecowym HEPA. Zamiast tego jest to filtr typu HEPA, który nie wyciągnie tylu cząsteczek z powietrza.
Większość dostępnych obecnie marek filtrów do pieców świadomych alergii, które nazywają się filtrami typu HEPA, jest zbudowanych w podobny sposób do prawdziwych filtrów piecowych HEPA, ale nie są tak gęste ani wydajne. Nie są w stanie wyłapać najmniejszych cząsteczek. Mogą być skuteczne tylko w 85%, gdy wielkość cząstek spadnie poniżej 1 mikrona. Prawdziwy filtr piecowy HEPA będzie zazwyczaj zbyt gęsty, aby działać na większości standardowych domowych pieców i może w rzeczywistości spowodować awarię pieca.
Filtr piecowy HEPA jest tak gęsty, że piec musi pracować ciężej, aby przeciągnąć powietrze przez materiał. Niektóre systemy pieców nie mają do tego wystarczającej mocy. Starsze piece mogą mieć szczególnie trudny okres. Jeśli zainstalowano filtr o bardzo wysokim współczynniku MERV lub prawdziwy filtr HEPA, konieczne jest sprawdzenie powietrza wychodzącego z otworów wentylacyjnych. Jeśli powietrze nie płynie tak bardzo, jak przed nowym filtrem, filtr może być zbyt gęsty i wydajny dla tego systemu pieca.
Opcją może być zakup oczyszczacza powietrza z prawdziwą filtracją HEPA. Inną alternatywą dla tych, którzy ze względów zdrowotnych potrzebują wysoko przefiltrowanego powietrza, jest zainstalowanie specjalnego filtra całodomowego między powrotem powietrza a paleniskiem. Są one często nazywane systemami mediów filtracyjnych. Używają filtra, który może mieć grubość od 3 do 5 cali (około 7.6 do 12.7 cm). Zwykle mają również wbudowany system, który pomaga w przepływie przez nie powietrza, aby odciążyć piec.