U ludzi fizjologia układu rozrodczego różni się u mężczyzn i kobiet. U obu płci fizjologia układu rozrodczego składa się z zewnętrznych i wewnętrznych narządów płciowych oraz gonad, ale co i gdzie znajdują się te narządy, znacznie się różni. Narządy płciowe to narządy i części ciała, które są niezbędne do reprodukcji. Gonady to narządy odpowiedzialne za wytwarzanie rozrodczych komórek rozrodczych, czyli gamet.
Fizjologia układu rozrodczego samców obejmuje kilka części ciała i narządów. Zewnętrzne narządy płciowe składają się z penisa i moszny. Wewnętrzne narządy płciowe znajdują się głównie w tych częściach ciała mężczyzny i obejmują jądra, najądrza, nasieniowód, pęcherzyki nasienne, cewkę moczową i prostatę. Męskie gamety lub plemniki są wytwarzane w jądrach, które są męskimi gonadami.
Podczas gdy większość narządów rozrodczych samców znajduje się w zewnętrznych narządach płciowych, nie dotyczy to kobiet. Fizjologia układu rozrodczego kobiet dotyczy głównie podbrzusza. Zewnętrzne narządy płciowe składają się z warg sromowych i łechtaczki, które są silnie osłabione do stymulacji seksualnej. Większość narządów to narządy wewnętrzne i obejmują pochwę, szyjkę macicy, macicę, jajowody i jajniki. W jajnikach samic powstają komórki jajowe lub jaja.
Nie tylko fizjologia układu rozrodczego jest różna u samców i samic, ale także proces, w którym gamety są wytwarzane i dostarczane podczas reprodukcji. Spermatogeneza to proces wytwarzania plemników w kanalikach nasiennych jąder, który trwa przez całe życie człowieka. Po wyprodukowaniu plemniki dojrzewają i są przechowywane w najądrzu w ramach przygotowań do zapłodnienia. Przed wytryskiem plemniki są mieszane z płynem nasiennym z gruczołu krokowego i pęcherzyka nasiennego w celu wytworzenia nasienia. Podczas wytrysku nasienie opuszcza prącie przez cewkę moczową.
U samic wszystkie komórki jajowe są obecne od chwili narodzin i przez całe życie kobiety nie będą produkowane żadne komórki jajowe. W okresie dojrzewania jaja zaczynają dojrzewać w jajnikach, a każdego miesiąca z jednego z jajników uwalniana jest jedna dojrzała komórka jajowa. To się zmienia między nimi dwoma. Następnie porusza się wzdłuż jajowodu do macicy. Jeśli nie dochodzi do zapłodnienia przez plemnik, podczas menstruacji komórka jajowa i wyściółka macicy są wydalane przez szyjkę macicy i pochwę.