Większość skutków ubocznych benzokainy jest stosunkowo łagodna i obejmuje podrażnienie skóry w miejscu aplikacji. U niektórych osób stosujących ten lek mogą wystąpić bóle głowy, zwiększone pocenie się lub niepokój. Poważniejsze działania niepożądane, które należy zgłosić lekarzowi w celu dalszej oceny, obejmują zawroty głowy, zmiany koloru skóry lub infekcje. Rzadko może wystąpić potencjalnie zagrażająca życiu reakcja alergiczna znana jako anafilaksja, powodująca objawy, takie jak przyspieszenie akcji serca, obrzęk twarzy lub trudności w oddychaniu. Wszelkie podejrzenia skutków ubocznych benzokainy powinny zostać ocenione przez lekarza, aby upewnić się, że nie występują poważne komplikacje wynikające ze stosowania tego leku.
Łagodne zaczerwienienie i dyskomfort w miejscu aplikacji są najczęściej zgłaszanymi działaniami niepożądanymi benzokainy i zwykle ustępują w ciągu kilku minut lub godzin po zastosowaniu tego leku. Silny ból, zwiększone zaczerwienienie lub tworzenie się pęcherzy mogą wskazywać na obecność alergii i należy to zgłosić lekarzowi. Czasami na dotkniętym obszarze mogą pojawić się również suche plamy skóry przypominające egzemę. Objawy te zwykle ustępują samoistnie po odstawieniu leku.
Infekcje skóry lub przebarwienia są stosunkowo rzadkimi skutkami ubocznymi benzokainy, ale wymagają natychmiastowej pomocy lekarskiej, jeśli się pojawią. Antybiotyki miejscowe lub doustne są zwykle stosowane w celu wyleczenia wszelkich infekcji, które rozwijają się w wyniku stosowania benzokainy. Wszelkie przebarwienia skóry powinny zostać ocenione przez lekarza, aby upewnić się, że nie występują poważne komplikacje, takie jak zmniejszone krążenie w dotkniętym obszarze. Objawy, takie jak ból głowy lub zawroty głowy, są zwykle łagodne, ale jeśli te działania niepożądane utrzymują się lub nasilają, należy powiadomić lekarza.
Napady padaczkowe, zmiany rytmu serca lub skrajne nudności są możliwymi skutkami ubocznymi benzokainy. Skurcze brzucha, biegunka lub wymioty należy poddać ocenie medycznej, zwłaszcza jeśli towarzyszy im gorączka. Czarny lub krwawy stolec lub wymioty przypominające fusy z kawy powinny skłonić do wizyty w najbliższym szpitalu, aby wykluczyć poważne uszkodzenie przewodu pokarmowego.
Anafilaksja jest jednym z najniebezpieczniejszych możliwych skutków ubocznych benzokainy i może spowodować śmierć w ciągu kilku minut bez pomocy medycznej w nagłych wypadkach. Ból w klatce piersiowej, trudności w oddychaniu i utrata przytomności, nawet na kilka sekund, są potencjalnymi objawami anafilaksji. Obrzęk twarzy, zwłaszcza obejmujący język lub gardło, może spowodować trwałe uszkodzenie mózgu i innych narządów ciała z powodu braku tlenu w krwiobiegu.