Większość ludzi jest w stanie jeść papaję bez żadnych problemów, chociaż istnieją pewne potencjalne skutki uboczne związane ze spożywaniem lub używaniem tego owocu. Niektóre z możliwych skutków ubocznych papai obejmują podrażnienie skóry, problemy z oddychaniem lub zaburzenia żołądkowo-jelitowe. Osobom uczulonym na produkty zawierające lateks zwykle zaleca się unikanie stosowania papai, podobnie jak kobietom w ciąży lub karmiącym piersią. Jednym z najpoważniejszych skutków ubocznych jedzenia papai jest potencjalnie zagrażający życiu typ reakcji alergicznej znany jako anafilaksja. Wszelkie szczegółowe pytania lub wątpliwości dotyczące skutków ubocznych w indywidualnej sytuacji należy omówić z lekarzem lub innym pracownikiem medycznym.
Podrażnienie skóry jest jednym z najczęściej zgłaszanych skutków ubocznych papai. W wyniku bezpośredniego kontaktu z papają lub produktami zawierającymi ten owoc może wystąpić swędzenie, obrzęk i rozwój wysypki przypominającej egzemę. Jasnoczerwona wysypka może również pojawić się wokół ust po zjedzeniu papai.
Problemy z oddychaniem mogą rozwinąć się jako skutki uboczne papai u osób wrażliwych na części tego owocu. Objawy alergii nosa, takie jak łzawienie, kichanie i kaszel, należą do najczęstszych objawów ze strony układu oddechowego. Pacjenci z astmą lub zapaleniem oskrzeli w wywiadzie mogą zauważyć pogorszenie objawów po kontakcie z papają.
Umiarkowane do ciężkich zaburzenia żołądkowo-jelitowe są możliwymi skutkami ubocznymi jedzenia papai. Objawy te mogą obejmować nudności, biegunkę lub zgagę. W poważniejszych przypadkach u osób bardzo wrażliwych na owoce, takie jak papaja, może dojść do uszkodzenia przełyku, żołądka lub jelit.
Osoba, która ma alergię na lateks, może być również uczulona na papaję i inne owoce. Lekarz nadzorujący zwykle dostarcza listę owoców, których należy unikać, gdy zostanie zdiagnozowana alergia na lateks. Kobietom w ciąży lub karmiącym piersią zazwyczaj zaleca się unikanie produktów zawierających papaję w celu zmniejszenia ryzyka dla nienarodzonego dziecka lub niemowlęcia.
Być może najpoważniejszym ze wszystkich możliwych skutków ubocznych papai jest reakcja alergiczna znana jako anafilaksja. Objawy, takie jak ból w klatce piersiowej, trudności w oddychaniu lub obrzęk twarzy, często wskazują na obecność tego typu alergii. Bez natychmiastowej pomocy medycznej anafilaksja może spowodować trwałe uszkodzenie mózgu, a nawet śmierć w ciągu kilku minut. Zwykle dzieje się tak z powodu silnego obrzęku gardła, który uniemożliwia dopływ tlenu do mózgu i innych narządów ciała.