Glicerol surowy lub gliceryna jest jednym z produktów ubocznych produkcji biodiesla. Surowa gliceryna nie nadaje się do większości zastosowań komercyjnych ze względu na wysoki poziom zanieczyszczeń i wymaga dalszego udoskonalenia przed wprowadzeniem do obrotu. Po oczyszczeniu, oczyszczona gliceryna może być używana w tych samych zastosowaniach, co odmiany produkowane konwencjonalnie, w tym produkty spożywcze i farmaceutyczne, kosmetyki i preparaty chemiczne. Rafinacja surowej gliceryny jest jednak kosztowna, a ekonomia procesu zmusiła producentów biodiesla do poszukiwania opłacalnych zastosowań surowego produktu, takich jak kompostowanie, spalanie, pasza dla zwierząt i materiały wybuchowe.
Stosowanie gliceryny z biodiesla można podzielić na dwie kategorie: produkty rafinowane, które spełniają komercyjne standardy czystej gliceryny oraz te oparte na nierafinowanej surowej glicerynie. Uszlachetnianie surowej gliceryny usuwa metanol, wolne kwasy tłuszczowe, wapń, magnez i siarkę oraz zapewnia minimalne stężenie glicerolu, składnika aktywnego gliceryny, na poziomie 80%. Czysta gliceryna oczyszczona z surowych produktów ubocznych biodiesla jest zasadniczo taka sama jak gliceryna wytworzona innymi sposobami i może być wykorzystywana w podobnych zastosowaniach. Z drugiej strony gliceryna surowa jest stosowana w takiej postaci, w jakiej jest, lub częściowo rafinowana.
Rafinowana gliceryna z biodiesla jest stosowana w wielu gałęziach przemysłu, w tym w przetwórstwie spożywczym, produkcji farmaceutycznej i formulacji chemicznej. Przemysł spożywczy wykorzystuje glicerynę jako słodzik, rozpuszczalnik i zagęszczacz. Jest również stosowany jako środek utrzymujący wilgoć w celu utrzymania wilgoci w żywności oraz jako wypełniacz w wielu produktach o niskiej zawartości tłuszczu. Czysta gliceryna z biodiesla jest również zawarta w wielu produktach spożywczych o niskim indeksie glikemicznym (IG), ponieważ ma mniej więcej taką samą wartość kaloryczną lub energetyczną jak cukier stołowy, ale nie podnosi poziomu cukru we krwi.
Przemysł farmaceutyczny wykorzystuje rafinowaną glicerynę z biodiesla w wielu produktach medycznych i higieny osobistej jako środek smarujący, utrzymujący wilgoć i poprawiający teksturę. Produkty te obejmują syropy na kaszel, środki wykrztuśne, pasty do zębów, produkty do pielęgnacji skóry i kremy do golenia. Mydło, produkty do pielęgnacji włosów i lubrykanty również zawierają glicerynę jako dodatek. Gliceryna jest również powszechnie stosowana jako środek utrzymujący tabletki w preparacie leku w stałej dawce.
Przemysł chemiczny ma kilka zastosowań dla oczyszczonej gliceryny z biodiesla. Zastosowania te obejmują dodatki do paliw, takie jak octan gliceryny, składnik powłok powierzchniowych oraz dodatki do farb artystycznych. Glicerynę można również znaleźć w preparatach do produkcji papieru, barwnikach, tuszach i środkach przeciw zamarzaniu.
Surowa lub częściowo rafinowana gliceryna jest stosowana w wielu gałęziach przemysłu, które nie wymagają wysokich poziomów czystości. Należą do nich produkcja materiałów wybuchowych, kompostowanie tlenowe oraz szereg produktów paszowych dla zwierząt. Gliceryna pochodząca z biodiesla jest również dodawana do produktów przeciwpyłowych i jest wykorzystywana jako baza do peletów paliwowych do spalania.