Melatonina jest hormonem wytwarzanym w szyszynce i czasami działa jako przeciwutleniacz. Główną funkcją tego konkretnego hormonu jest regulowanie funkcji zegara biologicznego organizmu, tak aby jednostka mogła osiągnąć regularny cykl snu i czuwania. Gdy poziomy melatoniny nie są zsynchronizowane, lekarze czasami podają suplement diety, aby przywrócić prawidłowy rytm dobowy i leczyć problemy zdrowotne, takie jak bezsenność. Jednak w tym okresie leczenia mogą wystąpić pewne skutki uboczne.
Podobnie jak w przypadku wielu rodzajów terapii hormonalnej, melatonina zapewnia korzyści, które trudno byłoby osiągnąć w inny sposób. Jednocześnie skutki uboczne melatoniny mogą wahać się od łagodnych do ciężkich. Z tego powodu ważne jest, aby przyjmować tylko dawkę przepisaną przez lekarza, a także zgłaszać lekarzowi wszelkie skutki uboczne, gdy tylko się pojawią. Umożliwi to personelowi medycznemu dostosowanie dawki w celu uzyskania jak największych korzyści przy minimalizacji występowania działań niepożądanych.
Wśród bardziej powszechnych skutków ubocznych melatoniny są objawy, które przypominają objawy przeziębienia lub grypy. Pacjent może odczuwać nawracające nudności, którym towarzyszą skurcze brzucha. Mogą również wystąpić epizody zawrotów głowy. Bóle głowy nie są rzadkością nawet przy małych dawkach melatoniny. Zazwyczaj lekarz jest w stanie przepisać leki, które łagodzą tego typu efekty bez ingerencji w korzyści płynące z suplementu hormonalnego.
Istnieje również pewna częstość występowania skutków ubocznych melatoniny, które towarzyszą korzyściom płynącym z możliwości zaśnięcia. Pacjent może stwierdzić, że sny stają się niezwykle żywe i realistyczne. W niektórych przypadkach mogą rozwinąć się koszmary senne, przez co pacjent czuje się mniej wypoczęty po pełnej nocy snów. Nieznaczne dostosowanie dawki może czasami złagodzić tego typu skutki uboczne.
Przykładem rzadszego efektu ubocznego jest utrata popędu płciowego zarówno u pacjentów płci męskiej, jak i żeńskiej przyjmujących hormon. W niektórych przypadkach pacjent traci zainteresowanie aktywnością seksualną, podczas gdy w innych czerpie mniejszą przyjemność z fizycznej bliskości. Istnieją doniesienia o przypadkach, w których leczenie melatoniną miało negatywny wpływ na funkcjonowanie zarówno męskiego, jak i żeńskiego układu rozrodczego.
Pacjenci, którzy już zmagają się z depresją, są bardzo narażeni na skutki uboczne melatoniny. Depresja może się pogłębiać, powodując u jednostki wyższy poziom drażliwości, a także pogłębiać chęć wycofania się z aktywności społecznych. Terapia melatoniną może mieć również negatywny wpływ na osoby cierpiące na zaburzenia lękowe, nawet przy braku depresji.
Ogólnie rzecz biorąc, osoby z wysokim ciśnieniem krwi, napadami drgawkowymi w wywiadzie lub z objawami choroby wątroby nie powinny poddawać się suplementacji melatoniną. Oprócz zwiększonego potencjału doświadczania pełnego zakresu skutków ubocznych, leczenie może również zaostrzyć każdy z tych schorzeń.